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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

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[交流] Gaussian确实跟不上时代发展了，并行不好已有15人参与

测试机器：
两片E5-2680v2处理器，64G内存，普通SAS硬盘，整个机器是按照DDRIII-1600配起来的，关掉超线程后，共20个计算核心
系统为Centos 6.4

测试题：
一个已经用cam-b3lyp优化好的200多个原子的体系，有氢氧硫碳氮碘锌。基组为6-31G(d)和LanL2DZ混用。现在拿着这个构型在同等水平下，进行单点能计算，很幸运的，两次测试的cycle都是13次。

当使用12核心并行的时候，总CPU时间为33分36秒，平均每核心运行时间2分48秒
当使用20核心并行的时候，总CPU时间为43分32秒，平均每核心运行时间2分11秒

多用的八个核心似乎没有发挥出应有的效能来

现在看来，E5-2643v2，6核心3.5G主频，出厂价1500+美元
对比E5-2690v2,10核心3.0G主频，出厂价2000+美元
如果以高斯为主要工具的话，很明显应该选E5-2643v2而不是E5-2690v2

从这个意义上讲，对于高斯计算来说，E5-2697v2属于昂贵的鸡肋

应该说年前买的一堆E5-2680v2和E5-2650v2的节点都买废了，花钱买教训，可惜了几十万银子。现在看来只能一个节点交两个任务才会比较合理了。

看来以后买cpu，钱少就买E5-2637v2钱多就卖E5-2643v2就好了

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