应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请大家帮助我解决下找过渡态中的燃眉之急 谢谢！卡好久了。。。
51/1返回列表
查看: 1679  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

布布_

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请大家帮助我解决下找过渡态中的燃眉之急 谢谢！卡好久了。。。 已有3人参与

最近找过渡态都是TS先用HF/3-21G找到后再用大基组m062x/6-31g*跑，但是最近的几个过渡态都是用小基组找到了，但是读CHK时候 跑不出来，两个途径的问题分别是两种情况：1.一种是过渡态能量一直小范围震荡，都到0.000X了但就是不平，需要加什么关键词或者怎样？加gdiis管用么？或者加IOP=(1/8=8)? 2：一种是一个成环(C=C和一个N成环，成环后下一步是H转移到C=C另一个C上），小基组虚频都是400多500多，但是读CHK后成环两个原子反而跑远了，无法成环，体系中氢键作用比较多，是不是HF和M062X方法之间的误差问题？有什么好办法解决么？基函数一千一左右，不用小基组直接TS的话跑1002就得一天多。。。太费时间了。。请大家指点下我该咋整，一个多月一点进展都没有，很焦急。。先谢谢大家了，请大家不吝赐教，感激不尽！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2014-07-04 09:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)
再加一句，算弱相互作用，还是很多的，就不要考虑小机组了，能上大的就上大 的吧。。。
赞一下 回复此楼
3楼2014-07-04 10:12:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-07-04 18:11:06
布布_: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-07-08 08:50:18
1、可以加gdiis，如果再没用的话我一般是把振荡的那几个结构拿出来单独算频率看看。
2、6-31g*我觉得不算大机组。大机组怎么也得到6-311++g(d,p)吧。。。而且你氢键多，为何不加弥散？我觉得加到6-31++g(d)。用HF给个初始结构和初始猜我觉得没问题，但是用来算弱相互作用我个人认为是“无意义”的， 如果是高斯09d以上版本的话可以用DFT-D，解决弱相互作用比较不错。

http://hi.baidu.com/sobereva/item/3cbf8904defdc4803d42e2e9
大神的这篇文章可供参考。

个人见解，欢迎批评指正。
赞一下 回复此楼
2楼2014-07-04 10:10:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jyzhao1981

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-07-04 18:11:14
布布_: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-07-08 08:50:30
对于你的第一个问题，加gdiis能解决。第二个反应直接用m062x/6-31g**做一个柔性扫描去寻找过渡态。你的体系中有氢键，泛函选的对，但基组至少要用6-31g**了。算1002花一天多的时间多正常的事情啊，你怎么那么急呢。对于含有非键作用的体系，HF很难给出正确的结果，它忽略了大部分电子相关啊。
赞一下 回复此楼
人生需要多少等待？
4楼2014-07-04 12:32:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

布布_

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-07-04 10:10:53
1、可以加gdiis，如果再没用的话我一般是把振荡的那几个结构拿出来单独算频率看看。
2、6-31g*我觉得不算大机组。大机组怎么也得到6-311++g(d,p)吧。。。而且你氢键多，为何不加弥散？我觉得加到6-31++g(d)。用HF给 ...

谢谢~
回复此楼
5楼2014-07-08 08:49:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 307求调剂 +9 冷笙123 2026-03-17 9/450 2026-03-19 22:44 by 学员8dgXkO
[考研] 0856调剂，是学校就去 +6 sllhht 2026-03-19 7/350 2026-03-19 19:50 by 制度的
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 0703化学调剂，求各位老师收留 +10 秋有木北 2026-03-14 10/500 2026-03-19 05:52 by anny19840123
[考研] 【同济软件】软件（085405）考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 298-一志愿中国农业大学-求调剂 +7 手机用户 2026-03-17 7/350 2026-03-18 14:34 by vgtyfty
[考研] 070300化学319求调剂 +6 锦鲤0909 2026-03-17 6/300 2026-03-18 13:22 by Iveryant
[考研] 304求调剂 +12 小熊joy 2026-03-14 13/650 2026-03-18 12:34 by Linda Hu
[考研] 0703化学求调剂 总分331 +3 ZY-05 2026-03-13 3/150 2026-03-18 10:58 by macy2011
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 0703 物理化学调剂 +3 我可以上岸的对� 2026-03-13 5/250 2026-03-16 10:50 by 我可以上岸的对�
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭