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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 精彩回帖：径向分布函数解析
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老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ddwy: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 嗯，很感谢你，我再考虑考虑 2014-07-04 15:30:50
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-07-08 16:20:39
严格说那也不是面积，总之是个积分。
RDF是在距离原子一定距离的地方，找到另一个原子的概率，与完全均匀分布情况下该处找到原子的概率之比，它反映的是一个有序性问题，存在近程有序就会出现峰。峰高而尖，说明有序性强，原子之间联系比较紧。RDF的积分反映了配位数。但是不同类的体系之间比较配位数的话，还有一个数密度问题，你整体数密度就低，你配位数当然少。
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11楼2014-07-04 10:20:16
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996630002xue

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 老虎大王 at 2014-07-04 10:20:16
严格说那也不是面积，总之是个积分。
RDF是在距离原子一定距离的地方，找到另一个原子的概率，与完全均匀分布情况下该处找到原子的概率之比，它反映的是一个有序性问题，存在近程有序就会出现峰。峰高而尖，说明有 ...

谢谢指教
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12楼2014-12-15 14:17:04
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夏陌86℃

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-07-02 14:58:05
峰的高度没有意义，第一个峰对应的横坐标才是你需要的两者之间的距离

你好，想请教一下，我做表面吸附的想得到吸附分子中的某一原子比如（C）与吸附表面之间的径向分布 函数，怎么set？谢谢
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13楼2015-01-06 21:20:41
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 夏陌86℃ at 2015-01-06 21:20:41
你好，想请教一下，我做表面吸附的想得到吸附分子中的某一原子比如（C）与吸附表面之间的径向分布 函数，怎么set？谢谢...

这个不能单纯set就能实现吧，一个原子到一个平面的垂直距离，得编写脚本，我不会啊
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14楼2015-01-07 08:36:16
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176286641cc

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 老虎大王 at 2014-07-04 10:20:16
严格说那也不是面积，总之是个积分。
RDF是在距离原子一定距离的地方，找到另一个原子的概率，与完全均匀分布情况下该处找到原子的概率之比，它反映的是一个有序性问题，存在近程有序就会出现峰。峰高而尖，说明有 ...

您好，我做RDF的时候发现改变Interval的值，径向分布函数峰值也会有变化，这是为什么呢？一个晶胞的配位数是个定值吗？
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小虫期待破茧成蝶！
15楼2015-04-06 22:37:05
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老虎大王

木虫 (著名写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 176286641cc at 2015-04-06 22:37:05
您好，我做RDF的时候发现改变Interval的值，径向分布函数峰值也会有变化，这是为什么呢？一个晶胞的配位数是个定值吗？...

峰值变化了多少呢？你的Interval又改变了多少呢？
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16楼2015-04-07 10:11:15
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176286641cc

新虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by 老虎大王 at 2015-04-07 10:11:15
峰值变化了多少呢？你的Interval又改变了多少呢？...

不好意思啊，没有讲清楚。。。。Interval从0.05改成0.2，峰值从7变到了5.5
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小虫期待破茧成蝶！
17楼2015-04-07 11:53:32
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lisuperyao

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 176286641cc at 2015-04-07 11:53:32
不好意思啊，没有讲清楚。。。。Interval从0.05改成0.2，峰值从7变到了5.5...

你interval变到0.2nm，点的间隔就是0.2nm，峰说不定在0.1到0.3之间了，就不显示了
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18楼2015-04-08 15:40:52
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茶味果冻

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-07-02 14:58:05
峰的高度没有意义，第一个峰对应的横坐标才是你需要的两者之间的距离

您好！图上是我计算的径向分布函数，我做的是水与金属氧化物表面的相互作用，图是选择所有水中的H原子与金属氧化物中所有氧原子分析出来的径向分布函数，这个正常嘛，水分子有1240个，峰值特别小，而且峰特别多，不知道怎么分析，求指点一二，万分感谢
精彩回帖：径向分布函数解析
QQ截图20150515165819.jpg
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19楼2015-05-15 17:01:52
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
19楼: Originally posted by 茶味果冻 at 2015-05-15 17:01:52
您好！图上是我计算的径向分布函数，我做的是水与金属氧化物表面的相互作用，图是选择所有水中的H原子与金属氧化物中所有氧原子分析出来的径向分布函数，这个正常嘛，水分子有1240个，峰值特别小，而且峰特别多，不 ...

请问这个现在会分析了吗？溶液中原子比较混乱，会出现峰低而多的情况，请问，你的这个图能说明说明情况？能反映H与金属氧化物中O的相互作用吗？
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20楼2015-09-21 16:51:08
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