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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zjy1818

银虫 (小有名气)

[交流] [求助]关于某些原子进行部分优化问题

我想做一个表面上的优化. 我只想对表面的一些吸附分子优化,而不想整体优化,如何设置? 是要用MODREDdundant一个一个在加F固定吗? 做过表面吸附的朋友都是怎末做的???
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oulihui666

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
我以前做过类似的优化,按照你的意思就是,固定表面原子,然后只允许吸附分子进行优化,在Gaussian计算中很容易实现,使用constant参数把表面原子的坐标,键角和二面角设置成常量,就固定不动了,同时把吸附分子的坐标设置成变量,就可以对它进行优化,我以前就是这样做的,效果还不错,很方便。你所说的modredundant好像只有在对体系增加对称性的情况下才会使用。
6楼2008-03-29 16:58:30
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SHY31

至尊木虫 (知名作家)

小木虫研究生院西南地区区长

优秀版主


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
做过表面吸附,但是都先单独优化再算吸附能的
小木虫研究生院
2楼2008-03-29 16:20:56
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zyy816

至尊木虫 (著名写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
用一个个F固定没有问题的呢,如果用gaussian计算,要考虑体系大小的问题,选择适当的方法。
3楼2008-03-29 16:38:13
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zzgyb

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫警察局局长

优秀版主

★ ★ ★
zjy1818(金币+1,VIP+0):又会了一招,没想到gaussview会兼容这些功能!
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
也可以使用Constants

例如

# HF/6-31G(d) Opt Test
Partial optimization for water
0 1
O
H1 O R
H2 O R H1 A
Variables:
R 1.0
Constants:
A 105.4

当然这样自己一个一个添加很麻烦
你可以使用GsView来固定
那样比较快
看看这个
利用GaussView固定原子坐标、键角、二面角的方法
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=703304&fpage=5
江南七怪+马玉+洪七公+一灯大师+周伯通教一个弱智儿童=郭靖,天下第一王重阳教七个天资不错的小孩=全真七子,全真七子×3《郭靖,这就是盲目扩招的后果
4楼2008-03-29 16:49:42
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