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水分子模拟
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大家好 我想请教一个简单的问题 我最近想单纯的模拟一下水分子在3000k 20atm下面的运动 我在ms里面建好模型 最后的data文件是可以运行的 有原子id 以及坐标 我想通过计算输出每个水分子的速度在不同方向的分量 但是我看dump命令里面有一个mol项 可以输出分子id 但是我的data里面全部都是原子id 怎么样才能计算输出每个水分子整体的速度分量呢？ 请大家帮帮忙啊。 |
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