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honghuzlj

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】自由边界条件

请问自由边界条件怎么讲,比方说如果把z方向用自由边界条件,x.y方向用周期性边界条件,是否就是说,不把z方向定为周期性边界,那z自然就为自由边界?
否则,自由边界条件的Fortran代码如何编写?谢谢

[ Last edited by lei0736 on 2008-3-25 at 22:38 ]
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yzhhlq_1983

木虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢建议
lz还是要慢慢看看分子模拟理论书籍,不要太急功近利!这样是有很大的好处!
"程序中的盒子是虚构出来的,实际是粒子占据的空间,表示为粒子的坐标,也就是说没有粒子的盒子是不存在的,有粒子才称为“盒子”"
很难理解你这句话,假如你的模拟盒子的边长是100*100*100,中间只有两个粒子,难到你理解为没粒子的地方,盒子就没有吗?不一定要粒子充满了盒子才叫盒子
实际上在md中,盒子的大小你人为控制的.关于npt系综你可以看看分子模拟中关于恒压条件的原理
21楼2008-04-10 08:57:54
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lei0736

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★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版!
所谓自由边界条件就是取无限大真空层 实际操作起来就是将Z方向的盒子取得比你的原子位置的最大最小值大很多或小很多 保证Z方向的表面不跟上下盒子相互作用即可
取原子位置最大值的100 ,1000倍都可以 如果作用力不是长程的话 取10倍足够了
2楼2008-03-25 22:38:26
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honghuzlj

木虫 (著名写手)

zzgyb(金币+0,VIP+0):不明白,应该说出你不明白的地方,这样别人就更有针对性的回答你
谢谢你,可是我还是不明白啊
3楼2008-03-25 23:08:57
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lei0736

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优秀版主

★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版!
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版!
晕 看来你的基本概念还需要加强
比如说原子占据的是10X10X10的立方盒子大小
那么对于模拟盒子 XY方向长度就取10 保证周期边界
Z方向取大于10 具体大多少看你的作用势范围
一般取50或者100是足够了 你要取1000当然更可以
那么Z方向是不是有很大的真空层?
这样就实现了Z方向的自由边界条件
够清楚不?
4楼2008-03-26 09:12:45
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