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shangyh

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】如何将两个分子对接?

准备计算连个分子之间的弱相互作用力,是不是需要将两个分子对接在一块,例如画出他们之间的氢键等,有两个问题:1.氢键在chemdrew中能否画得出;2.画出的分子用高斯能计算吗?

[ Last edited by lei0736 on 2008-3-25 at 20:20 ]
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montclimber

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
对接需要专门的软件.可以在chemdraw中画出分子结构,再转化成对接软件要求的格式.实现对接后,可显示氢键距离.
另外,Guassian计算也需要格式转化后进行.
每天醒来都觉得不奔跑梦就要死了。
2楼2008-03-27 20:19:58
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saitou

木虫 (正式写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢补充说明
楼上牛人啊
补充一点:最好先确认分子的大小,据此选好要用的软件,再考虑如何计算弱力的问题。除非你计划自己写程序
不抛弃,不放弃
3楼2008-03-28 15:13:49
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