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wubingran

金虫 (正式写手)

[求助] 求助~~分析调控序列和转录因子的软件

求助~~~给位
推荐或介绍一下~~~~~有什么样比较好的关于分析
调控序列和转录因子相结合分析的软件~~~~~~~~

我现在手中有大量的类似序列~~是一些调控序列~~~现也知道这些序列所结合的转录因子~~~~

现在想分析一下~这些序列以怎样的方式能与转录因子较好的结合~~分析调控序列的各个位点应该是怎样的碱基与转录因子结合才能达到最大优化~~
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1楼 2008-03-23 00:25:11
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tlcool318

铁虫 (初入文坛)
试试这个网站上的东东吧！！
http://www.bbioo.com/Soft/biosoft/
可能有点用！
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2楼2008-03-23 08:40:45
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wubingran

金虫 (正式写手)
这个里面好像没有我想要的~~~~~~~~~
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3楼2008-03-31 18:39:57
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bsksln

银虫 (小有名气)
★ ★
wubingran(金币+2,VIP+0):谢谢你的建议
楼主指的是调控序列（DNA）与转录因子（蛋白质）相互作用的分析吗？
据我所知，这不是普通的软件能做到的。这样的分析至少涉及分子动力学模拟和蛋白与核酸相互作用两门学问。我们学校有个牛人就是做分子动力学的，有两台计算机装了专业的软件专门算这个，发过science。
我的个人建议就是，单单通过序列想计算出它和调控因子的作用是很难的，试图找找和这些序列同源或相似的序列，看看它们与调控因子的作用。
如果不行的话，就直接请教一下牛人。
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分子细胞
4楼2008-04-01 09:01:58
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wubingran

金虫 (正式写手)
就是~~~~~
目前为止~~~~还是没有发现这方面的~~~~~软件~~~~
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5楼2008-04-03 16:35:28
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