24小时热门版块排行榜    

查看: 956  |  回复: 6

berry94

铁虫 (初入文坛)

[求助] 基因克隆 已有2人参与

亲爱的们,有没有根据转录组测序结果克隆基因的啊?小女子从测序结果中筛选出我的目的基因序列,可是相关性的有好几条,在NCBI上BLAST后也不能具体确定是哪一条,所以只能根据ORF相对可靠的序列设计引物,克隆基因,可是一直没得到有效结果,所以特来求助,望相关领域的哥哥姐姐们给予一些意见
回复此楼
实验快快出结果
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-06-06 12:38:06
转录组测序一般都是可编码的,可以到NCBI试试blastX。或者把你说的几个相关基因拿出来做个信息学分析,看看哪一个和你预想的功能最相似。
2楼2014-06-06 08:26:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

berry94

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-06-06 08:26:40
转录组测序一般都是可编码的,可以到NCBI试试blastX。或者把你说的几个相关基因拿出来做个信息学分析,看看哪一个和你预想的功能最相似。

你好,生物学分析是指什么嘞?比如?谢谢啊
实验快快出结果
3楼2014-06-06 21:34:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by berry94 at 2014-06-06 21:34:46
你好,生物学分析是指什么嘞?比如?谢谢啊...

比如看看有没有相似度比较高并且研究比较多的基因,同物种或者不同物种都可以,或者看看有没有哪些比较特别的结构域,或者蛋白的定位啊、GO注释之类的。
4楼2014-06-07 12:05:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

berry94

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liuderong at 2014-06-07 12:05:49
比如看看有没有相似度比较高并且研究比较多的基因,同物种或者不同物种都可以,或者看看有没有哪些比较特别的结构域,或者蛋白的定位啊、GO注释之类的。...

嗯嗯,最终还是两条序列,我还是先根据这两条序列先设计引物做着吧
实验快快出结果
5楼2014-06-07 18:43:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+4, 鼓励交流! 2014-06-08 02:55:48
楼上说的好,转录组都是可以表达翻译的基因,所以这个参考性一般

你可以把你找到的两条基因对比下,大体上能够确定基因的类型,比如一条神经方面的,一条胚胎发育的,哪个跟你更相关,这个可以找得到

另一方面,你测序时候,应该大体定位到某条染色体吧,这个两个基因难道是都很接近这条染色体?
天行健
6楼2014-06-07 23:41:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

berry94

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-06-07 23:41:58
楼上说的好,转录组都是可以表达翻译的基因,所以这个参考性一般

你可以把你找到的两条基因对比下,大体上能够确定基因的类型,比如一条神经方面的,一条胚胎发育的,哪个跟你更相关,这个可以找得到

另一方面 ...

定位到染色体?我们测的转录组,这样也可以吗?
实验快快出结果
7楼2014-06-09 07:40:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 berry94 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +4 瞬息宇宙 2026-08-10 4/200 2026-08-11 02:02 by 旁观2020
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +3 Tide man 2026-08-10 3/150 2026-08-10 21:48 by GZUZM
[基金申请] FileCode能看出啥? +7 要乐观耀哥 2026-08-10 15/750 2026-08-10 19:29 by 要乐观耀哥
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +14 Lanmanbaby 2026-08-09 22/1100 2026-08-10 14:57 by wwncly
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +11 archvillain 2026-08-04 13/650 2026-08-10 14:41 by seekfind
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
信息提示
请填处理意见