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oudis

银虫 (小有名气)

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[交流] 生物计算

想从事生物计算方面的研究，如DNA计算、膜计算等，不知道用哪些编程软件比较好，还请前辈推荐入门书籍等等。

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1楼 2014-05-29 15:48:53

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

BioChen

银虫 (正式写手)

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oudis: 金币+7 2014-05-31 20:05:54

引用回帖:

10楼: Originally posted by oudis at 2014-05-31 09:01:44
专业是控制理论与控制工程，硕士研究方向是图像处理与模式识别。现在准备去当老师，想做一下生物信息中的算法部分，主要研究生物计算，感觉交叉学科比较容易发论文，SCI也好发，以后评职称容易。...

如果只是想发论文，凭职称，而且周围没有人做这个，楼主是不是思考一下换个方向。一个人单打独斗很辛苦的，或许在别人看来发文章很容易的领域，在您这里可能就不是那么回事了。
算法在一定程度上独立于编程语言。我感觉，生物信息学里面所说的算法和计算机科学中所说的算法有点不一样，生物信息学中算法就是找到一种方法解决问题。有时候，你的闪光点甚至就是问题的提出，光芒盖过了解决办法本身。perl和python，能够快速开发出程序（脚本语言的特性）验证我们的想法。一开始我们并不关注效率，想法正确后，优化程序，把需要效率的部分用C/C++改写。
楼主计算机方面的知识不在我之下，学习perl、python或者C/C++应该没有什么问题。
建议楼主，加强生物学本身的知识。思考，我想解决什么样的生物学问题，我从什么地方得到数据，我的数据生物学意义是什么，如何组织数据，我最后想得到什么样的结果等等，然后才是算法。
生物信息学里面有很多细分领域，不管你是不是大师，都无法精通所有事情。选择一个方向也是很重要的，楼主周围无人搞这个，如何选方向也是个麻烦事。尽可能想办法与人合作吧，比如找你们学校生物学方向的老师，问问他有没有问题需要用生物信息学来解决的。您帮他解决问题的本身就可以写一篇生物信息的文章。
我主业是生物实验，生物信息学只是我的工具，从来没有分析过什么算法。仅供参考，说的不对的地方，还请海涵。