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fanwq258

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-30 20:16:50
玉米基因组已经测序完成,进数据库中找就行了。maize GDB
要么好好活,要么死,拒绝半死不活
11楼2014-05-30 18:58:52
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农田耕者

金虫 (小有名气)

引用回帖:
11楼: Originally posted by fanwq258 at 2014-05-30 18:58:52
玉米基因组已经测序完成,进数据库中找就行了。maize GDB

具体操作方法呢
还行
12楼2014-05-31 09:29:42
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fanwq258

木虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 农田耕者 at 2014-05-31 09:29:42
具体操作方法呢...

把你的序列在数据库中blast,就能找到相应的染色体位置,以及前后的所有序列。
要么好好活,要么死,拒绝半死不活
13楼2014-05-31 10:33:04
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grase

捐助贵宾 (职业作家)


引用回帖:
10楼: Originally posted by 农田耕者 at 2014-05-30 17:01:23
有没有具体的操作方法,指点一下...

上面都有啊,看一下就ok了。
14楼2014-06-03 08:40:57
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profax

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-05-29 16:52:45
用你的基因在玉米基因组中做blast,找到匹配区后,往前延2000bp就是你的启动子序列。

你好!在往前延伸的时候发现该基因上游2000bp内有另外一个基因,且转录方向和该基因相反的,也就是说两个基因的上游序列是同一段序列?还有,这个2000bp内包含另一个基因,分析的时候有影响吗?谢谢回复啦
15楼2015-01-27 04:39:42
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

16楼2015-01-27 10:04:15
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
15楼: Originally posted by profax at 2015-01-27 04:39:42
你好!在往前延伸的时候发现该基因上游2000bp内有另外一个基因,且转录方向和该基因相反的,也就是说两个基因的上游序列是同一段序列?还有,这个2000bp内包含另一个基因,分析的时候有影响吗?谢谢回复啦...

关于这个,我只知道基本理论,没有深入了解过。不过我觉得两个基因上游序列在同一段双链上应该是合理的,因为是不同的链。另外,2000bp并不是绝对的,有的基因的启动子区就几百bp,所以你这两个基因启动子区也未必就共用序列。
17楼2015-01-27 13:00:50
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