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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】Gaussian03 在Linux下无法计算
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skyflyzw

铁杆木虫 (职业作家)

人饥己饥，人溺己溺！中华爱 ...

[交流] 【求助】Gaussian03 在Linux下无法计算

dell服务器安装 red hat enterprise linux 5.0版本，发现高斯无法计算，出错信息为：
Erroneous write during file extend. write 1408 instead of 4096
Probably out of disk space.
Write error in NtrExt1.

硬盘挂载分区为：
/dev/mapper/VolGroup00-LogVol00   
                    98493920   2231036  91178932   3% /
/dev/sdb1         101086     12951     82916  14% /boot
tmpfs             4091300         0   4091300   0% /dev/shm
/dev/sdb2         41286828    181152  39008392   1% /home
/dev/sdb3         10317860    232708   9561032   3% /soft

希望大家能给予建议和帮助！

[ Last edited by skyflyzw on 2008-3-19 at 22:17 ]
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危险人物！请勿接近！ [img]http://pic.emuch.net/200805/18/61d610f3cafe6fd3220633f88359a56e.gif[/img]
1楼2008-03-19 11:39:54
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papaxia

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
csfn(金币+3,VIP+0):thanks~
磁盘分区好像 有点 问题：试试重新分一下，
主分区： / 根分区  10G
             /boot 分区 200MB
扩展分区：

      swap分区 大小等于内存，如2G的内存 ，swap就2G
      /user 分区 大一点为好，可以安装软件的地方  〉20G
      /home 分区  为硬盘余下的部分

安装完成后，用root账号把gaussian安装在/user下，开放g03权限，按照程序设置一下，肯定不会有问题啦。
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2楼2008-03-19 14:46:32
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papaxia

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
csfn(金币+3,VIP+0):thanks~
1. chown -R root.users g03
2. chmod -R 775 g03
3. 修改/etc下的csh.cshrc,加入命令运行需要的信息

setenv g03root /usr
source $g03root/g03/bsd/g03.login

4. source csh.cshrc
5. exit
6。 重新登陆
OK
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3楼2008-03-19 14:53:50
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skyflyzw

铁杆木虫 (职业作家)

人饥己饥，人溺己溺！中华爱 ...
谢谢，我试试
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危险人物！请勿接近！ [img]http://pic.emuch.net/200805/18/61d610f3cafe6fd3220633f88359a56e.gif[/img]
4楼2008-03-19 22:19:03
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sandf

木虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢建议
请楼主查查这几个问题先：
1，是否刚运行就出现这种错误
2，这个提示 Probably out of disk space. 很清楚了，出错时用 df 命令查一下就知道对不对。
3，安装现在的gauss都很简单的，如果别人不用的话，安装在自己的用户下即可如：/home/user/soft/g03...，所以你把home的分区分足够即可。也就是不用root，g03 0c g03 0d 版本的都用过.
赞一下(10人) 回复此楼
努力呀努力，不要成为奴隶。
5楼2008-03-20 07:50:12
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skyflyzw

铁杆木虫 (职业作家)

人饥己饥，人溺己溺！中华爱 ...
谢谢您的建议！
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危险人物！请勿接近！ [img]http://pic.emuch.net/200805/18/61d610f3cafe6fd3220633f88359a56e.gif[/img]
6楼2008-03-20 08:56:03
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hbinjm

木虫 (著名写手)

小柔的爸
呵呵，学到东西了
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无
7楼2008-05-07 03:44:45
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znet0201

金虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
应该是兼容的问题，这是个“著名”问题了，如果可以google下，会发现Fedora Core也是这样。

LZ如果解决了，请告知。

[ Last edited by znet0201 on 2008-5-7 at 03:52 ]
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8楼2008-05-07 03:50:08
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hbinjm

木虫 (著名写手)

小柔的爸
哈哈
我刚用red hat enterprise linux 5.0通过了G03C，是有几个地方要改一下
头痛了好几天呢
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无
9楼2008-05-11 01:25:58
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jjf_sxnu

铜虫 (正式写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
这一出错信息应该在Fedora 4和5后出现的，用root用户执行：
echo 0 > /proc/sys/kernel/randomize_va_space

可以使之正常运行，为方便 的话可以将这一句写入
/etc/rc.local
每次开机自动运行
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10楼2008-05-11 03:26:00
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