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xusongwhy

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] [求助]请高手指教(愿送上三十个金币表示感谢)

最近想转到计算化学的方向,但不知从何入手,我看到我们这边有一个老师在用GAUSSIAN计算,我很想学,请高手指教!

他的方向的大概是这样的:
1.确定一个母体
2.用CHEMOFFICE 画出母体结构式,得到一些信息
3.用高斯软件计算,得到一些参数
4.再用SPSS软件拟合,
5.最后建立模型用QSAR预测一些母体的卤代物的一系列的信息!

我很想学,但不知从何入手,哪位高手能教我一下吗!需要哪些知识才能学会呀?

[ Last edited by xusongwhy on 2008-3-19 at 13:06 ]
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cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer

★ ★ ★ ★ ★
suntao1982(金币+1,VIP+0):非常感谢!
csfn(金币+4,VIP+0):3q
最好对量子化学有一些了解,不然你算了半天可能不知道那结果意味着什么,但是这比较慢,看看那本《电子结构在化学中的应用》吧,(好像是这么写的)
聪明人知道自己是傻子,傻子以为自己是聪明人
2楼2008-03-18 16:38:53
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SHY31

至尊木虫 (知名作家)

小木虫研究生院西南地区区长

优秀版主

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
suntao1982(金币+2,VIP+0):非常感谢!
csfn(金币+8,VIP+0):3q
我大概知道你要学什么了

我的建议是:

你直接看文献吧,就先看看相关的中文文献
看看别人用的是什么方法

然后你就用Gaussian的例子练习一下,很快的就可以上手了

当然主要的是会分析会看结果

你们用的是chem3d还是chemdraw呢>

我建议直接用gaussianview吧,更方便的呢

太笼统了

你就先看看简单的,很快就上手的

LZ加油
小木虫研究生院
3楼2008-03-18 16:50:17
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xjz816

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢
csfn(金币+3,VIP+0):3q
lz想学的是构效关系
也就是说,分子的结构参数,会影响分子某个方面应用的性能
从这个角度说,楼长应该先找到一个目标,比如说,苯环不同取代基团,对进一步二取代的影响
在这个基础上,就可以利用gaussian计算不同基团的电子云啊,然后,预计出取代位置什么的
这个过程,正如楼上其他朋友说的,你要先有点基础理论
然后再学习软件的应用
心是一切行为的根本,以什么心做事,最终就会成就什么样的人
4楼2008-03-18 18:34:29
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K372

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):多谢指导
csfn(金币+8,VIP+0):3q
先对结构化学要有一个比较全面的了解,知道结构化学模拟分子结构的基本思想和基本方法,然后对量子化学的基本概念要有一个清晰的认识,知道量子力学计算的出发点、算符和波函数的物理概念。然后要熟悉GAUSS的使用方法,最好是结合实例,充分实践,不要死读用户手册,推荐精读《Exploring Chemistry With Electronic Structure》的相关章节。一定要对各种算法有一个比较全面的了解,HF-SCF、POST-HF、DFT等方法有不同的计算特性和适用范围,用单一方法去面对所有问题是完全不可行的。
后面的软件我也不清楚了,不过要告诫LZ一条:不要过分迷信GAUSS的计算结果,GAUSS的计算结果在大多数情况下是可以接受的,并不意味着所有情况下GAUSS都能给出完全正确的计算结果,这并不是由于GAUSS软件不够健壮,而是由于目前的计算水平和理论需要相去甚远,为了能使计算变得现实,现有的量子化学理论引入了大量的近似,从而导致了牺牲精度所带来的不稳定性。此外,理论代数运算和计算机的数值运算是有很大差异的,这些都导致了GAUSS在一定程度上的不稳定性。
5楼2008-03-18 19:47:10
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herosmzd

银虫 (正式写手)

★ ★ ★
csfn(金币+1,VIP+0):thanks~
csfn(金币+2,VIP+0):3q
楼主是指QSAR吧,经常到小木虫下点资料看看,慢慢就上手了,还有不懂就发贴求助,呵呵,我就是这么过来的
6楼2008-03-19 08:45:06
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tianguixin521

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):thanks~
csfn(金币+2,VIP+0):3q
自己学习一下结构化学的知识,在找一些有关线性代数方面的书。把这两方面的知识弄通,再学习高斯方面的知识。
7楼2008-03-19 09:41:43
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虚谦

至尊木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
csfn(金币+2,VIP+0):thanks~
csfn(金币+3,VIP+0):3q
我建议LZ首先看相关的文献,然后确定体系,再就是利用高斯计算了,关于高斯方面就是看高斯手册了,厦大的论坛和小木虫上都有,在计算的过程中很可能会遇到一些问题,入502,999,301,716...死掉的情况,自己先在手册上查,然后解决掉,我感觉这个解决的能力挺关键的,因为一些时候这些情况要是解决不好的话,会直接影响到你做的东西~!
大家都说我是个好人,其实,我也是这么想的~!
8楼2008-03-19 11:11:51
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xusongwhy

铁杆木虫 (著名写手)

大家太好了,我好感动,版主帮我把30个金币分给大家吧!谢谢了
奉献越多,得到越多!!!
9楼2008-03-19 13:12:03
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