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leixiao

新虫 (小有名气)

[求助] 基因条形码 已有2人参与

基因条形码是什么?求解释一下。

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Lau_Kimura

铁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
DNA条形码(DNA barcode)是指生物体内能够代表该物种的DNA片段,具有标准、有足够变异、易扩增且相对较短等特点。植物DNA条形码的主要作用就是物种鉴定,尤其对一个区域内物种快速鉴定的作用很大。http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2012/8/268555.shtm

估计它可以被理解为物种间特异性分子标记。
2楼2014-05-25 13:19:26
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良家妇女

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
简单说来,就是用一段通用序列(比如its序列)作引物,做pcr,然后根据扩增出来的不同结果来鉴别物种,就跟条形码是一样的,在同一格式下对不同物种进行区分
3楼2014-05-25 17:44:58
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leixiao

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 良家妇女 at 2014-05-25 17:44:58
简单说来,就是用一段通用序列(比如its序列)作引物,做pcr,然后根据扩增出来的不同结果来鉴别物种,就跟条形码是一样的,在同一格式下对不同物种进行区分

我做牛的病毒,要去进行分型。我想先找到牛的基因条形码,然后去进行分型。该怎么做呢?

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4楼2014-05-26 12:26:29
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leixiao

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Lau_Kimura at 2014-05-25 13:19:26
DNA条形码(DNA barcode)是指生物体内能够代表该物种的DNA片段,具有标准、有足够变异、易扩增且相对较短等特点。植物DNA条形码的主要作用就是物种鉴定,尤其对一个区域内物种快速鉴定的作用很大。http://news.sci ...

也就是说各个物种的基因条形码都不同了。我想找牛的基因条形码,然后去分型。该到哪里去找?要分型该怎么做呢?

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-05-26 12:31:58
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良家妇女

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by leixiao at 2014-05-26 12:26:29
我做牛的病毒,要去进行分型。我想先找到牛的基因条形码,然后去进行分型。该怎么做呢?
...

请说得详细一些
动物微生物样品就试试用CO I相关的引物吧,或者你查查看有没有更合适的引物序列,然后做个做个高通量测序
6楼2014-05-26 16:15:27
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leixiao

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 良家妇女 at 2014-05-26 16:15:27
请说得详细一些
动物微生物样品就试试用CO I相关的引物吧,或者你查查看有没有更合适的引物序列,然后做个做个高通量测序...

我做BVDV的分型,需要它的基因条形码吗?如果需要,怎么去找呢?求指点。。

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2014-05-26 19:44:43
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