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loser2007

[交流] 【求助】关于弱相互作用力的计算

两个分子间的相互作用,在画两个分子构型是不是直接将他们画在一起进行优化并计算单点能,有什么要注意的问题啊

[ Last edited by loser2007 on 2008-8-13 at 18:30 ]
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suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫

★ ★
loser2007(金币+2,VIP+0):谢谢
基本上是这样做的,但是前提是要保证分子构型正确!
做中国人的化学!!!!
2楼2008-03-17 21:57:13
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suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫

有什么问题可以联系我,QQ292309800
做中国人的化学!!!!
3楼2008-03-17 21:59:13
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ustc

金虫 (著名写手)

★ ★
suntao1982(金币+1,VIP+0):非常感谢!
loser2007(金币+1,VIP+0):3Q
弱相互作用力的计算特别要注意BSSE校正这一块的!
我们以前做过一些,也可以找我联系!
4楼2008-03-18 08:45:12
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tutu2000

金虫 (正式写手)

★ ★
suntao1982(金币+1,VIP+0):PBE 在分子间相互作用较好!欢迎常来!
loser2007(金币+1,VIP+0):3q
同意楼上的,而且要注意基组的选择,B3LYP在这方面就不太好。最好有文献的支持。
5楼2008-03-18 09:05:47
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liutao_jlu822

银虫 (小有名气)

★ ★
suntao1982(金币+1,VIP+0):这一篇是分子内的相互作用啊!欢迎常来!
loser2007(金币+1,VIP+0):3q
可以看看吉林大学 Qing-Jiang Pan and Hong-Xing Zhang的关于Au相互作用的文章 参考一下
superman
6楼2008-03-18 09:57:32
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K372

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢一直关注
loser2007(金币+1,VIP+0):3q
弱相互作用是比较难计算的。所用方法必须较高以保证精度,所用基组必须较大而且应包含弥散函数(会导致收敛性下降)。若需要高精度结果必须加上BSSE校正,并且还应在长程作用的力程上加一些键函数来改善计算结果。
总之比较复杂!若LZ在实际操作过程中遇到困难的话,欢迎来发帖说明情况,我们会尽量给予解答!
7楼2008-03-18 19:57:25
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zyy816

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
suntao1982(金币+1,VIP+0):感谢!
loser2007(金币+1,VIP+0):3q
一般弱相互作用要MP2或者以上的方法计算的,普通密度泛函不行。
或者永QCISD(t),但是这个只能用到比较小的体系
8楼2008-03-19 03:59:55
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K372

铜虫 (小有名气)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版!
一般认为CCSD(T)与QCISD(T)比较时,CCSD(T)以非常少的精度损失换取了略微多一些的计算代价节省,如果LZ打算采用LS的QCISD(T),不妨先考虑UCCSD(T)
由于键比较长,加上U比较保险,虽然CCSD(T)具有大小一致性。
9楼2008-03-20 09:20:52
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ccc13

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
先分别对两个分子进行优化,优化好的分子再对照相应的文献参考,按最可能结合的样子画到一块,再进行优化 计算注意bsse校正
10楼2008-03-25 10:14:39
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