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发夹结构属于unpaired secondary structure吗? 已有2人参与
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| 看到一篇文献讲的是一个RNA结合蛋白更易结合发夹结构的序列,但是有一处结论是该RNA结合蛋白倾向于结合unpaired secondary structure?这个非配对的二级结构式是指发夹结构吗?或者说发夹结构属于unpaired secondary structure?非配对的二级结构不是很理解。求大神解答,谢谢! |
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wizardfan
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【答案】应助回帖
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hairpin中有两处unpaired 1,最大的就是所谓的terminal loop,hairpin就是一条RNA自己跟自己配上了,这样他必须绕弯过来,这个弯或大或小,但是肯定是存在的,这个地方就是terminal loop,这个loop肯定有配对不上的。 2,RNA hairpin的一个特征就是不完全配对,hairpin的非terminal loop一般叫stem,stem上往往有局部没配对的区域,这些区域叫法就很多了,最常见的bulge,pseudoknot之类。这也也是没有配对的。 个人认为,凭经验,这里别人形容的,应该是一个单链RNA结合蛋白,但是又喜欢结合在hairpin的terminal loop。这种情况比较常见。 |
3楼2014-05-20 12:44:07
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