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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » NCBI查序列
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hakkie

新虫 (初入文坛)

[交流] NCBI查序列 已有3人参与

NCBI里搜的某基因的mRNA和cDNA的序列数差很多，一个是2000+，一个是800+，为什么核算数不一样？？？高手解答一下？？多谢了~
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1楼 2014-05-14 11:16:34
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冉兆星

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-05-14 22:17:50
这个基因是真核生物的还是原核生物的？真核生物有DNA得到的mRNA可能存在内含子。
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2楼2014-05-14 11:18:44
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-05-14 22:17:59
比对一下，看差异在什么位置。先弄清楚差异到底是在UTR区还是编码区。在编码区的话可能是可变剪切。在UTR区的话可能是不同人、不同实验提交的结果，提交的mRNA序列两端UTR长些，cDNA可能包含的UTR短些。
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3楼2014-05-14 21:28:02
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
用cDNA吧，mRNA的不同长度的utr都有可能造成长度不一
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4楼2014-05-15 04:21:43
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