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missducksong

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于1-octanol desolvation free energy的计算,高斯是否可以呢?

求大神指导:(1)1-octanol desolvation free energy(正辛醇去溶剂化自由能),这个能用高斯算吗?我看高斯中可以计算总溶剂化自由能。
(2)我看文献上说:正辛醇去溶剂化自由能,用hydration shell 模型算的,但是hydration shell 模型是什么呢  不明白哈,求大神指点。
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


1 这就是溶剂化自由能的负值。高斯里用SMD、PCM等都可以算
2 hydration shell可能就是指显式水模型,即在体系外包一层水分子,然后同时用溶剂模型表现更外侧的水。

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2楼2014-05-14 17:28:09
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missducksong

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2014-05-14 17:28:09
1 这就是溶剂化自由能的负值。高斯里用SMD、PCM等都可以算
2 hydration shell可能就是指显式水模型,即在体系外包一层水分子,然后同时用溶剂模型表现更外侧的水。

前辈我的悬赏金币怎么没办法送给您呢?给您送支红花吧,谢谢您的指导。
我想问的是:
(1)hydration shell这个显式水模型是可以在高斯里用SMD、PCM构造的模型吗?
(2)您的意思还是指 在高斯里用SMD、PCM直接算出1-octanol desolvation free energy,计算时SMD、PCM跟显式水模型没有关系呢?
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3楼2014-05-14 19:57:44
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