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jimuchun

银虫 (小有名气)

[求助] NEB计算晶面上原子配对问题 已有1人参与

最近要用CLNEB计算块体材料中缺陷扩散能垒。初态和末态结构都已优化好,发现晶面上的原子在优化后坐标差别比较大,比如同一个原子在初态优化后坐标为(0.005,0.000536,0.99576),末态结构优化后坐标为(0.9997,0.997,0.99943),根据周期边界条件毫无疑问这两个位置基本等价。对于这种情况插入Images时,脚本是否能判断?还是做前要处理下?因为我原来没处理直接用脚本产生,运行了300多步不收敛,不知是不是这个原因导致插入images不合理。
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jimuchun: 金币+10, 有帮助 2014-05-15 10:01:44
你需要先用 查看一下movie.xyz 文件中的 线性插值做出来的路径是否合理
仅仅用nebmake.pl生成images 就计算 是不太合理的
2楼2014-05-13 18:43:53
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jimuchun

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by emilyoyang at 2014-05-13 18:43:53
你需要先用 查看一下movie.xyz 文件中的 线性插值做出来的路径是否合理
仅仅用nebmake.pl生成images 就计算 是不太合理的

mm怎么把金币送给你
3楼2014-05-15 09:59:01
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