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NEB计算晶面上原子配对问题 已有1人参与
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| 最近要用CLNEB计算块体材料中缺陷扩散能垒。初态和末态结构都已优化好,发现晶面上的原子在优化后坐标差别比较大,比如同一个原子在初态优化后坐标为(0.005,0.000536,0.99576),末态结构优化后坐标为(0.9997,0.997,0.99943),根据周期边界条件毫无疑问这两个位置基本等价。对于这种情况插入Images时,脚本是否能判断?还是做前要处理下?因为我原来没处理直接用脚本产生,运行了300多步不收敛,不知是不是这个原因导致插入images不合理。 |
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emilyoyang
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