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晴天非雪

银虫 (小有名气)

[求助] 使用amber做结合自由能分解出现提示错误:bad atom type:br

使用amber做结合自由能分解时候,由于我所用的小分子中含有溴,出现提示错误:bad atom type:br, 请问如何修改mdread.f文件中br的参数。在添加br参数时候,除了添加x(L165-1+i),还需要改一个br相对应的x(L170-1+i),x(L175-1+i),x(L180-1+i),这些值的具体数值应该设为多少
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心宽路才宽
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yuanmie

铁虫 (初入文坛)

请问楼主这个问题解决了吗,我现在也遇到这个问题了!!
2楼2014-07-15 21:09:20
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