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xiaobo5412

金虫 (小有名气)
引用回帖:
19楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-05-16 18:13:49
这两天我们实验室正好整修，没办法帮你计算，还是把CASTEP发来看看。

好的，这是我算过600次和1000次都没有成功的那两个文件，还有一个是我按你说的改过自旋和切断能的文件，请你指导一下，谢谢。
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    • 2014-05-17 11:25:03, 641.15 K
21楼2014-05-17 11:26:13
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
20楼: Originally posted by xiaobo5412 at 2014-05-17 11:23:50
好的，这是我算过600次和1000次都没有成功的那两个文件，还有一个是我按你说的改过自旋和切断能的文件，请你指导一下，谢谢。...

截断能的影响如何不能判断，因为从文件中可以看到自旋极化产生了影响，我们看文件最终结构给出的体系自旋密度，另外一份文件也就没必要看了。
2*Integrated Spin Density   =    0.251472E-12
2*Integrated |Spin Density| =     18.4801   
大致可以估计是反铁磁性的。

另外，你做了Mulliken population，很容易看到（我只把有自旋密度的部分列出来了）
Species   Ion     Hirshfeld Charge (e)  Spin (hbar)
  Mn       1                 0.36       -2.08
  Mn       2                 0.36        2.06
  Mn       3                 0.36       -2.08
  Mn       4                 0.36        2.06
这四个Mn大致上自旋密度相等，两个反号，也可以分析出是反铁磁性的。

不过依旧难以完全判断你材料本身的磁性（我对自旋优化的方法不是很信任），建议将全部原子修改到高自旋态再进行优化，做个对比，看看是否能够优化得到其他的自旋态能量如何。
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xiaobo5412
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22楼2014-05-17 11:52:18
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xiaobo5412

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
22楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-05-17 11:52:18
截断能的影响如何不能判断，因为从文件中可以看到自旋极化产生了影响，我们看文件最终结构给出的体系自旋密度，另外一份文件也就没必要看了。
2*Integrated Spin Density   =    0.251472E-12
2*Integrated |S ...

那怎么把它改成高自旋态呢，具体参数怎么设置，你能不能用那个物质的cif按照你的想法，比如要进行几何结构优化，你会事先做哪些工作，再进行几何结构优化，具体每一步骤的参数怎么设置，然后你能不能把设置的参数截图发给我，要是你有时间的能不能帮我算一下，我刚入门，好多的都不懂，这一段时间麻烦你了。
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23楼2014-05-19 10:54:49
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
23楼: Originally posted by xiaobo5412 at 2014-05-19 10:54:49
那怎么把它改成高自旋态呢，具体参数怎么设置，你能不能用那个物质的cif按照你的想法，比如要进行几何结构优化，你会事先做哪些工作，再进行几何结构优化，具体每一步骤的参数怎么设置，然后你能不能把设置的参数截 ...

Modify-Electronic Configuration-spin里面可以进行适当的修改。体结构的几何优化一般也是按照一个个的步骤，先确定你进行scf的一些参数，一般需要测试的是截断能和k，如果有磁性的话就需要加上自旋极化，这些CASTEP Calculation的选项卡都能找得到，我就不截图了，这些参数的设置站内应该是有些资料的。因为目前一些个人原因，时间和精力可能比较有限，所以就没办法帮你计算了，有些东西还是得自己学。如果有什么问题可以在站内询问，这里高手也是挺多的，我就是个老菜鸟而已。。。
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24楼2014-05-19 11:20:40
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xiaobo5412

金虫 (小有名气)
引用回帖:
24楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-05-19 11:20:40
Modify-Electronic Configuration-spin里面可以进行适当的修改。体结构的几何优化一般也是按照一个个的步骤，先确定你进行scf的一些参数，一般需要测试的是截断能和k，如果有磁性的话就需要加上自旋极化，这些CAST ...

谢谢，这段时间真是麻烦你，也学到蛮多，主要我也是刚开始接触，之前我们课题组没有接触过这个方面，所以蛮多不懂，感谢这么认真地指导，以后还得多向你学习。
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25楼2014-05-20 10:55:20
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梦梦小呆

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-05-12 17:29:57
coarse未必好收敛，不合理的截断能和k都有可能导致不收敛。有磁性自旋极化必须考虑，里面的Mn比较可能带有磁性。另外k和截断能都要测试，不行你就先处理这些问题。导致scf不收敛的原因很多，只好逐个排查。...

这个怎么考虑加不加自旋，如果只是单层石墨烯的掺杂或是吸附不含金属原子的大分子时要不要加spin
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我就是我，是颜色不一样的烟火，天空海阔要做最坚强的泡沫！
26楼2015-01-20 15:17:47
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
26楼: Originally posted by 梦梦小呆 at 2015-01-20 15:17:47
这个怎么考虑加不加自旋，如果只是单层石墨烯的掺杂或是吸附不含金属原子的大分子时要不要加spin...

保险起见加上总不会错，只是计算量大些。
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27楼2015-01-20 15:47:07
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梦梦小呆

木虫 (著名写手)
引用回帖:
27楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-01-20 15:47:07
保险起见加上总不会错，只是计算量大些。...

恩，还有，一般选不选use smearing呢
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我就是我，是颜色不一样的烟火，天空海阔要做最坚强的泡沫！
28楼2015-01-20 19:33:11
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
28楼: Originally posted by 梦梦小呆 at 2015-01-20 19:33:11
恩，还有，一般选不选use smearing呢...

纯金属必选，甚至考虑cold smearing（MP），以及k小于4的时候必须考虑一个不太大的smearing ，其他体系就得看情况了。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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29楼2015-01-21 02:11:30
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ysun2014

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by xiaobo5412 at 2014-05-12 16:50:36
我是一下就选了精度fine，几何结构优化要先选精度比较低的吗？...

主要跟计算精度有关，看你计算的体系他有多大，一般fine就可以了。保证收敛的情况下，设置的越小越好，这样计算成本低。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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30楼2015-01-22 08:43:38
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