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orion416

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】如何将坐标文件转化成ms中的3d文件

请问呢一下各位，如何将应用cage软件作出的坐标文件转化为ms可以用的.xsd或者其他类型可以进行计算的文件呢？我把ms中的3d图形文件export为.car文件，再用相应的坐标在相应的位置改变，可结果出来的图形乱七八糟的，也不知道怎么弄了，特来到此求助大家，希望能得到大家的帮助。
谢谢大家了。

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-28 at 22:00 ]

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1楼 2008-03-11 10:06:49

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acridine

木虫 (正式写手)

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专业: 凝聚态物性 II ：电子结构

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):多谢详细解答

尝试一下用.xyz 文件
格式比较简单
下面一个就是甲烷的结构
－－－－－－－－－－－－－－－－－－－
5

C 0 0 0
H 1.14 0 0
H -0.38 1.075 0
H -0.38 -0.537 0.931
H -0.38 -0.537 -0.931

5是总原子数目
把上面横线之下的文字保存为.xyz格式就可以用ms打开了

或者用类似你的方法，可以某个结构export为.pdb文件，由于格式也比较简单，改起来比较容易