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wenzhipeng

新虫 (初入文坛)

[求助] 我犯了一个挺有意思的错误,大家进来讨论一下吧 已有6人参与

故事是这样的:我现在有一批人DNA样品,是今年1月份提取的,由于是第一次跟着师兄师姐做实验不太熟悉,所以在样品资料上犯了个错误。样品顺序可能混淆了。如果,我能判断DNA样品的性别,那么我就能知道我是否混淆了样品顺序。于是我就设想,我能不能用PCR扩增一段特异性存在于Y染色体上的片段,由此来判断样品性别。

         如果能扩增出特定片段就是男性,不能则为女性。我想请教一下大家,这个方案可行不?还有就是在哪才能查找到只在染色体上才存在的片段
         我金币也就只有十几个了,大家包涵。。另外我觉得这个错还挺有意思的···
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zep616745243

银虫 (小有名气)

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wenzhipeng(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-04-30 20:11:24
听起来是挺合理的,不过得去找特异性序列啊,还的设计引物,忒麻烦了,另外 操作过程小心你自己的DNA混淆
只有不断地失败才会成功
2楼2014-04-30 12:57:49
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wenzhipeng

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zep616745243 at 2014-04-30 12:57:49
听起来是挺合理的,不过得去找特异性序列啊,还的设计引物,忒麻烦了,另外 操作过程小心你自己的DNA混淆

刚才百度了一下,还真有。引物都是现成的,准备认真看一下,然后打电话订引物····怕老板知道了,挨训····
3楼2014-04-30 13:16:31
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖


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wenzhipeng(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-04-30 20:11:34
你这件事是常规流程,大胆去干吧
比如ATCC,就会检测他库中收录细胞的性别情况
但是细胞系不如正常人组织稳定,基因组老是有变化
4楼2014-04-30 14:51:23
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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直接找SRY基因或者检验Y微缺失的引物就可以了
5楼2014-05-01 00:10:54
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DoRbIr

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这样不一定能知道顺序吧?比如8个样品,1~4男,5~8女,2和3顺序错,看不出来的。但对你试验没有影响吗?
6楼2014-05-01 01:16:19
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meng_xu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先是可以找到这样的引物的,也可以P出来你想要的性别结果

其次,错就是错,该承认就承认,就像DoRbIr说到,也不一定能弄明白顺序,到后来,一塌糊涂,那就耽误的不光是你自己的时间和精力了。

做实验这个东西,可以做不出来,可以做错,但是不能不踏实,否则,一切都是白费。
7楼2014-05-01 08:01:50
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Asura-

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

DNA鉴定性别是可行的,我i最近也在做这方面的实验。跟楼上说的差不多吧,NCBI找一下SRY基因的序列,然后设计个引物后面的就简单了
8楼2014-05-04 15:39:38
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