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mengbiotech

金虫 (小有名气)

[求助] 求助,如何预测酶蛋白中的亲核试剂及质子供体 已有2人参与

我现在用pymol绘制了蛋白模型,现在需要在催化中心标注出亲核试剂及质子供体的氨基酸。
1. 有没有在线的预测,输入蛋白序列后可以直接预测出氨基酸?如果需要,请给出网址;
2. 是否需要与同源蛋白比对,确定目标氨基酸?如果需要,请提供软件名称及大概步骤。
求赐教!
谢谢!
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mengbiotech

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by smutao at 2014-04-29 13:22:42
请关注如下氨基酸
TYR ARG 等

谢谢解答!
我已经知道蛋白属于GH3,且两个氨基酸分别是Glu和Asp。
求教如何在蛋白序列上定位?
热爱生活,热爱生命
4楼2014-04-29 21:34:11
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iamthinking

铁杆木虫 (正式写手)

浪客琴心

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-04-29 16:58:01
用H++试试,一个可以氨基酸质子化的工具
走马行酒醴,驱车布鱼肉~——咦,我的酒呢?
2楼2014-04-29 13:04:41
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smutao

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-04-29 16:58:06
本帖内容被屏蔽

3楼2014-04-29 13:22:42
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