应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » CH4在MOF-5中的自扩散系数计算
303/3返回列表上一页123
查看: 7847  |  回复: 29
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 模拟EPI ，点击这里进行查看

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
20楼: Originally posted by xiaoyao715 at 2014-11-06 16:50:44
很好的帖子，刚开始接触这一块，很多都不懂，照着楼主的方法想要重复一下。弱弱的问一句：生成MSD.xcd和MSD.xtd，观察xcd文件之后，该如何选择有效数据范围啊？我得到的y=35.3865*X+1.03534，这样的一条斜线。跟楼主 ...

根据一些文献，自扩散的模拟时间需要达到ns级别，且前面几ns是平衡结构过程，不能用于计算自扩散系数，我看的文献是2.5ns开始的数据拟合直线。我的帖子只是做演示所以没有完整模拟6ns，实际值可以查阅文献看看

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(2人) 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
21楼2014-11-06 19:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyao715

金虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
21楼: Originally posted by pigrass at 2014-11-06 19:36:22
根据一些文献，自扩散的模拟时间需要达到ns级别，且前面几ns是平衡结构过程，不能用于计算自扩散系数，我看的文献是2.5ns开始的数据拟合直线。我的帖子只是做演示所以没有完整模拟6ns，实际值可以查阅文献看看
...

好的，我再查文献看一下，非常感谢。
赞一下 回复此楼
22楼2014-11-06 21:32:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangfei天空

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
21楼: Originally posted by pigrass at 2014-11-06 19:36:22
根据一些文献，自扩散的模拟时间需要达到ns级别，且前面几ns是平衡结构过程，不能用于计算自扩散系数，我看的文献是2.5ns开始的数据拟合直线。我的帖子只是做演示所以没有完整模拟6ns，实际值可以查阅文献看看
...

学长 您好  请问Adsorption和sorption有什么区别吗  哪个做两种气体的吸附最好呢
我现在用的是sorption做完了两种气体的吸附    怎样得到吸附密度随孔径的分布曲线呢
两种气体是怎样用forcite来计算各自的扩散系数呢   
好像discover也可以动力学分析，请问应该用哪个来计算扩散系数呢
恳请得到学长的帮助  谢谢您
赞一下 回复此楼
23楼2014-11-23 15:18:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
23楼: Originally posted by wangfei天空 at 2014-11-23 15:18:13
学长 您好  请问Adsorption和sorption有什么区别吗  哪个做两种气体的吸附最好呢
我现在用的是sorption做完了两种气体的吸附    怎样得到吸附密度随孔径的分布曲线呢
两种气体是怎样用forcite来计算各自的扩散系 ...

我所了解的，adsorption locator是建模时将小分子放在可能的吸附位置；sorption是计算吸附等温线等性质，判断最可能吸附位置的，一般实验文献有吸附等温线数据，利用sorption模块可以判断模型的合理性；discover和forcite等动力学模块可以计算自扩散系数，大致过程就是我帖子里说的，两种小分子就用adsorption locator加入两种小分子吧；一个结构应该加几个小分子可以根据sorption得到loading。。。。不同孔径的结构的吸附密度？我觉得可以sorption模块计算不同孔径结构在相同条件下的loading。。。。。以上只是我的理解，仅供参考

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
24楼2014-11-23 19:16:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

秦无殇

新虫 (小有名气)
送红花一朵
很贴心
回复此楼
25楼2015-11-10 13:51:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

秦无殇

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
MOF5.cif导入MS中是这样的，如何弄成那种周期性的？（我不确定周期性这个说法准确不，或者叫晶胞？）
CH4在MOF-5中的自扩散系数计算
QQ截图20151110142658.png
赞一下 回复此楼
26楼2015-11-10 14:29:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
26楼: Originally posted by 秦无殇 at 2015-11-10 14:29:09
MOF5.cif导入MS中是这样的，如何弄成那种周期性的？（我不确定周期性这个说法准确不，或者叫晶胞？）

QQ截图20151110142658.png
...

是下载的这个帖子里的cif吗 如果是的话不应该没看到晶胞的样子啊
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
27楼2015-11-10 15:03:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

字符画生

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
L-J势能参数是如何设置的，我看到好多文献把吸附质的势能参数δ与ε，如CO2的δ=2.789Å，ε=29.66K，这些力场参数是力场自带的还是需要自己编辑。
赞一下 回复此楼
28楼2017-09-09 11:51:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
28楼: Originally posted by 字符画生 at 2017-09-09 11:51:10
L-J势能参数是如何设置的，我看到好多文献把吸附质的势能参数δ与ε，如CO2的δ=2.789Å，ε=29.66K，这些力场参数是力场自带的还是需要自己编辑。

MS的力场编辑器可以编辑部分力场，打开可编辑的力场文件可以设置某些化学键为LJ势能形式
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
29楼2017-09-09 18:03:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

何海何海
送红花一朵


发自小木虫Android客户端
30楼2017-12-01 17:45:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pigrass 的主题更新
303/3返回列表上一页123
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 u1xkze8ybe 2026-07-30 7/350 2026-07-31 12:10 by syhhffkrym
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 u1xkze8ybe 2026-07-30 3/150 2026-07-31 12:08 by syhhffkrym
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 u1xkze8ybe 2026-07-30 6/300 2026-07-31 12:05 by syhhffkrym
[教师之家] 基础研究怎么拉横向，学校到款任务越来越多，难以完成 拉横向，都有哪些途径啊 +6 锦衣卫寒战 2026-07-28 6/300 2026-07-31 11:27 by syl200707
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液，是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 小木虫看见有人已经知道结果了 +15 1234567wang 2026-07-25 19/950 2026-07-31 08:30 by ZJTJZ
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +8 布布和一二 2026-07-30 8/400 2026-07-31 01:51 by alongwaytogo
[基金申请] 系统今天又提示维护了，估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[基金申请] 微信指数没变化，科研之友没阅读 +14 wangze12014 2026-07-28 17/850 2026-07-30 20:10 by kissu88
[考博] 申请2027年材料/化学类博士 10+3 考研老狗? 2026-07-25 5/250 2026-07-30 19:33 by 白色木鱼
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[基金申请] 今年的WR进展到哪一步了？ +5 wsgjhwz 2026-07-25 9/450 2026-07-30 12:59 by 可淡不可忘
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
[基金申请] 时间戳他又来了 +14 晓晓爱翠翠 2026-07-26 17/850 2026-07-29 16:30 by 呵呵二哥
[有机交流] 这个自发加氧反应的机理是什么？ 50+4 YUAN2273 2026-07-25 7/350 2026-07-29 12:27 by xiaobenpu
[基金申请] 没消息就是被刷了呗 +13 lambert2014 2026-07-24 14/700 2026-07-29 10:38 by msh145800
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 11/550 2026-07-29 05:50 by drbart
[基金申请] 同事接到电话了，我却没有 +4 1234567wang 2026-07-27 4/200 2026-07-28 10:11 by GOODLUCKER
[基金申请] 准备明年的基金了 +5 Tide man 2026-07-27 5/250 2026-07-28 09:25 by newfuzzy1
[分析] 水蒸气蒸馏法乳化现象 +3 月光娇娇 2026-07-26 3/150 2026-07-26 23:25 by caiyun
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭