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wubingran

金虫 (正式写手)

[求助] （放弃）怎么求p-value~~~~自己已经解决~~

现共有150条序列（长20bp），这些序列的某一位点上：A出现的频数为30，C出现的频数为25，G出现的频数为25，T出现的频数为70~~~
如果假设该位点ATGC都是随即出现的，即理论频数都是150*1/4=37.5~~~~~

那我怎么求得p-value（在于小概率事件比较）~~~~通过p-value来检验这点具有显著性~~~~~

今天下午泡图书馆~~~~~在《生物统计学基础》孙尚拱译这本书中~~~找到了方法~~~~~

[ Last edited by wubingran on 2008-3-10 at 18:09 ]
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1楼 2008-03-08 16:58:38
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Daoist

木虫 (正式写手)
★ ★
wubingran(金币+2,VIP+0):对您的关注和意见表示谢意~~~~~~~~~
用卡方检验,本人认为差异极显著
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2楼2008-03-08 17:13:43
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wubingran

金虫 (正式写手)
我已经用过卡方检验~~~导师说再用一下~~~~p-value更好一些~~~~~
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3楼2008-03-08 17:23:17
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molcov

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
wubingran(金币+3,VIP+0):对你的关注和意见表示~感谢~~~
零假设：

假设该位点ATGC都是随即出现的，即理论频数都是150*1/4=37.5，而你的实际抽样符合正态分布

显著水平：

0.001

有如上两个前提，应该可以算出p值了 呵呵
spss10.0（一个很经典的版本）就可以做了
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4楼2008-03-09 22:19:08
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wubingran

金虫 (正式写手)
我之前用过软件spss15.0，的确也算出来了~~~可是我想知道他们的步骤（导师要求我们必须懂得它们原理和步骤）~~~~~~~~所以才来问问的~~~~

[ Last edited by wubingran on 2008-3-10 at 11:46 ]
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5楼2008-03-10 11:45:02
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