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大司马

铁虫 (小有名气)

[求助] ms操作问题 已有2人参与

文献中看到这样操作,有些步骤不理解,求教!

先建立晶面层(已用focite中的compass进行了energy,geometry calculation),然后:
1约束整个晶面层分子,在盒子中心随机放置一个水分子,进行分子动力学计算
2分别弛豫晶体表面的半层、单层和双层晶体分子,进行分子动力学计算

第一步中:在盒子放一个水分子,是直接复制黏贴吗?还是其他操作?
第二步中:弛豫晶体表面,用的是哪个模块的什么操作?

请高手指教,不胜感激!
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dujunhui

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

1.直接复制粘贴
2.用focite就可以,还有其他的分子动力学模块,GULP,也可以
3楼2014-10-22 10:31:39
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查看全部 4 个回答

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1.直接复制粘贴
2.即不constraints这半层、单层、双层晶体分子,其他的晶体原子constraints。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
2楼2014-04-24 18:18:29
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RicKillMercy

木虫 (正式写手)

为什么我固定再分子动力学  会报错。说固定就不是动画,取消才能算、
4楼2017-08-07 16:19:27
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