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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 对筛选分离的六个菌做了16sRNA或18sRNA鉴定，跨学科的，序列看不懂，求大神指导！！！
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tianyaluo

银虫 (正式写手)

[求助] 对筛选分离的六个菌做了16sRNA或18sRNA鉴定，跨学科的，序列看不懂，求大神指导！！！ 已有3人参与

18sRNA（1）
AAGTATAAGCATTATACGGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTTCCGTTCTACATGGATAACCGTGGAAAATCTAGAGCTAATACATGCGTAAAGCCCCGACTTTTGGAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAATCAATGCCCTCGGGCCTTTTGATGATTCATAATAACTTTTCGAAGCCCATGGCCTTGCGCCGGGGCTGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTTTTCACGGGTAACGGGGAATAAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACAGGGAGGTAGTGACAATATATAACGATACAGGGCCTTTGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATGTAAATACCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACTTTGGGCCTGGGCGGGCGGTCTACCTATGGTAAGTACTGCAGCGGCCGGGTCTTTCCTTCTGGCTAGCCCTCGGGCGAACCAGGACGATTACTTTGAGGAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGGATATATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTATGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCATCGTAATGATTAATAGGGACGGTCGGGGGCATCAGTATTCAGTTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTAACTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGACGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATTGGATGGCGCTCTTTTGCCCATTCAGCACCTTACGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTTGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACGTAATAAGGATTGACAAGTTAGAGACTTCTCTTGATCTTACGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTTTTAGTCCTTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGGACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGGGCTGCGAGCATCTGCTCGTGGGCTCTTCCTAGAGGGACTAT
18sRNA（2）
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16sRNA（1）
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16sRNA（2）
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16sRNA（3）
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16sRNA（4）
CGTGCTATACATGCAAGTCGAGCGAATGGATTAAGAGCTTGCTCTTATGAAGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCCATAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAACATTTTGCGCTGCATGGCGCGAAATTGAAAGGCGGCTTCGGCTGTCACTTATGGATGGACCCGCGTCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCTTTCGGGTCGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTGCTAGTTGAATAAGCTGGCACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGTGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGAAGAGGAAAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATATGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGAAGTTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAACCCTAGAGATAGGGCTTCCCCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGACGGTACAAAGAGCTGCAAGACCGCGAGGTGGAGCTAATCTCATAAAACCGTTCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCGAAGTCGGTGGGGTAACCTTTTGGAGCCAGCCGCCTAAGGTGGGACAGATGATTGGGGTGAA
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纯种理工男，偏好文艺风，很有好奇心，还需多锻炼！
1楼 2014-04-17 22:33:27
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树2979

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
tianyaluo: 金币+1, ★有帮助, 谢谢帮助！ 2014-04-21 21:48:15
直接去NCBI上面做比就可以了，一般都能得到跟你的序列相似度最高的菌株的

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2014-04-18 02:03:07
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yuruoyuxue

木虫 (正式写手)

~！@#￥%&…&%￥#@！~

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
tianyaluo: 金币+1, ★有帮助, 谢谢啊，表示纯英文界面有压力……………… 2014-04-21 21:47:52
楼主去NCBI上面比对序列呗，看和哪个种属的亲缘关系近
赞一下 回复此楼
要努力活着，因为我们会死很久很久的！
2楼2014-04-17 22:37:36
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CuidiGege

铁虫 (小有名气)
Why 18S?  so confused...
赞一下 回复此楼
数学是石，敲出物理之火；物理是火，点燃化学的灯；化学是灯，照亮生物的路；生物是路，通向埋葬理科生的坑。。。
4楼2014-04-18 05:27:25
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CuidiGege

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tianyaluo: 金币+8, ★★★很有帮助, thank you for you help , best wish for you！ 2014-04-21 21:51:47
Hello, I added one document(a few pictures) indicating the procedure which might help you to figure out how to deal with those sequences.

Make full use of the online source and information!

Cheers!
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    • 2014-04-18 06:02:26, 6.09 M
数学是石，敲出物理之火；物理是火，点燃化学的灯；化学是灯，照亮生物的路；生物是路，通向埋葬理科生的坑。。。
5楼2014-04-18 06:03:50
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