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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » R语言做heatmap的问题
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jjm717

木虫 (小有名气)

[求助] R语言做heatmap的问题

我有2组物质，用spss作出了它们的相关性，现在我想用R语言画一个相关性的热点图（heatmap），相关性的数值从-1至1要用蓝色到红色表示，如图所示。谁能写一段代码呢？
R语言做heatmap的问题

补充下：按照http://flowingdata.com/2010/01/2 ... -and-easy-solution/的教学，已经能作出初步的图了，但是还是有几个问题：
1、我数据明明是这样分布的：第一列是从Hydroxybutyrate开始的
R语言做heatmap的问题-1
但是做出来的图片的分布却变了，第一列是从methylamine开始了，Hydroxybutyrate掉到最下面去了，而且左下角到右上角的对角线的格子的颜色为什么回是不一样的，应该都是1才对啊？
R语言做heatmap的问题-2
2、图的颜色我想做成-1至1是从蓝色到红色的效果，并且最好旁边能出来一条表示颜色变化的图。
R语言做heatmap的问题-3

或者用matlab来做，我用matlab做出来只有红、绿、黑三种颜色，如何才能作出更多的颜色，就像第一个图那样。
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yzywlyy

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1楼 2014-04-17 18:31:08
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yzywlyy

新虫 (小有名气)
送红花一朵
急！在线等

您好  楼主：
有两副图（un）weighted unifrac.dist.heatmap 比较5个样本的群落结构，这个图是请人帮忙完成的，但是自己不会分析，不知有何结论？

请您帮我分析一下好吗？解释一下这两幅图反映的主要几个问题即可。


非常感谢！
R语言做heatmap的问题-4
1.jpg


R语言做heatmap的问题-5
2.jpg
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2楼2014-08-31 10:05:45
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