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usermxy

铁虫 (初入文坛)

[交流] 有好用的DNA序列拼接软件吗

各位大虾,

我是一个分子生物学实验新手。

现在所做课题涉及大量引物设计、测序、拼接、比对和聚类分析,数据处理工作量很大。

我比较头疼的是PCR产物拼接和校对,不知道有什么方法和软件等可以比较方便、迅速、准

确地实现这个目的,如果能实现批处理就最好不过。

还有,如果用PCR产物测序,最后寻找引物序列时,一定要引物序列和模板100%匹配才能认

为测序结果可靠吗?有些测序公司人员说只要有连续6个碱基能匹配就可相信测序结果了,

有什么根据吗?
[search]DNA 序列 拼接[/search]
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annwt

木虫 (正式写手)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
DNAstar比较全面,拼接,聚类分析很方便,我感觉还可以,引物设计也可以参考Primer,那是专门引物设计的。
2楼2008-03-05 20:41:15
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ypt86

铁虫 (初入文坛)

这些

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
dna man  还有vector nti 就是很好的软件
3楼2008-03-05 22:00:31
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
Phrap-phred 也可以
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
4楼2008-08-29 17:52:08
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boouy

银虫 (正式写手)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
最佳选择-sequencher!!!
5楼2008-08-30 13:19:03
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