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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » M062x方法适合算氢键嘛~
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郝玉蕾

银虫 (小有名气)

[交流] M062x方法适合算氢键嘛~ 已有6人参与

最近用M062x/6-311+G**计算某些纯有机体系，催化剂参与了相互作用（氢键），可是作业却总是跑不出来，尝试了各种方法（调整构型， scf收敛经验）~
各位大虾赶紧进来瞧一瞧~是不是方法和基组的问题呢(⊙o⊙)…
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1楼 2014-04-17 09:50:12
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
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gmy1990: 金币+1 2014-04-17 15:32:24
M062X对有些体系的收敛的确很难
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2楼2014-04-17 15:25:11
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
m062x处理弱相互作用应该很不错啊。能贴出来输入文件和输出文件的末尾吗
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理论与计算化学，化学物理，生物物理
3楼2014-04-18 07:08:36
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郝玉蕾

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by agent99 at 2014-04-18 07:08:36
m062x处理弱相互作用应该很不错啊。能贴出来输入文件和输出文件的末尾吗

%chk=2d-IN1A.1.95.chk
%mem=12GB
%nproc=8
#T GFINPUT IOP(6/7=3) M062x/6-31++G** SCRF(PCM,solvent=Dichloromethane) opt freq

mechanism

0 1
C                 -0.86779643    4.35813774   -1.02076942
C                 -0.70294653    5.73781919   -1.13892915
C                 -1.76302445    6.51409044   -1.59714732
C                 -2.97687379    5.94541809   -1.96625654
C                 -3.11495524    4.56388038   -1.86289494
C                 -2.07954269    3.76815382   -1.38712525
H                  0.24264354    6.19515821   -0.87154246
H                 -3.79388517    6.56254570   -2.32564105
H                 -2.21162900    2.69547902   -1.29115381
C                 -1.55019942    7.99427068   -1.75544545
C                 -4.42707189    3.94873690   -2.26274052
F                 -5.44606294    4.42029026   -1.51905888
F                 -4.42957388    2.61294858   -2.13554749
F                 -4.73436824    4.22536890   -3.54485961
F                 -2.70750610    8.67385756   -1.78189326
F                 -0.80711425    8.50475740   -0.75931411
F                 -0.90276519    8.28314109   -2.90316913
N                  0.18718855    3.52322753   -0.60024574
H                  0.23895323    2.62666554   -1.07019047
N                  1.97410989    2.78548124    0.58155938
H                  2.12111896    2.12244819   -0.17399936
C                  5.79794361    5.08919722    0.82347634
C                  6.84104052    4.32598333    1.35383613
C                  6.58878569    3.08338933    1.94298792
C                  5.27862647    2.61948842    1.99395712
C                  4.23979154    3.38983670    1.46754293
C                  4.48094137    4.62436848    0.87806252
H                  6.01268474    6.04883702    0.36362756
H                  7.85949375    4.69847491    1.29963381
H                  7.40513350    2.48802788    2.34284541
H                  3.66289226    5.21058109    0.46787277
C                  3.35833173    1.20500357    1.87950332
H                  2.63049702    0.64444864    2.47472749
C                  4.73334418    1.32716431    2.55945474
H                  5.36421465    0.45722476    2.35413811
H                  4.60756452    1.40010908    3.64688221
C                  2.91986866    2.67110495    1.67049335
H                  2.43080724    3.03887757    2.57874255
O                  3.47067300    0.63655575    0.57937613
H                  3.64868677   -0.30817821    0.65598634
C                  0.99226569    3.69710678    0.49654899
S                  0.75148373    4.91295627    1.64210011
N                  2.68647601   -1.08128689   -1.67558288
C                  1.69734091   -1.03937134   -2.63161706
C                  1.74172769   -2.17725143   -3.39243391
C                  2.82247205   -2.97606525   -2.88203345
C                  3.36717582   -4.22733301   -3.22452420
C                  4.44240675   -4.71419114   -2.49855175
C                  4.99393281   -3.97612858   -1.42806224
C                  4.48016511   -2.74094970   -1.06569464
C                  3.39307668   -2.25396909   -1.80327217
H                  2.86509550   -0.36046208   -0.99341855
H                  1.03325556   -0.18913073   -2.69039339
H                  2.94887715   -4.80099469   -4.04659104
H                  4.87130427   -5.67836360   -2.75333071
H                  5.83629162   -4.38442643   -0.87843587
H                  4.90241180   -2.17197640   -0.24311420
H                  1.08495018   -2.41731499   -4.21596458
输出文件还没出来呢，就是出不来，慢呀，我在节点上看了一下，基本上能量算出来要24小时~然后频率计算~您给看看
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4楼2014-04-18 11:24:10
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lkui486

至尊木虫 (职业作家)
★
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基组用的太大了。对于跑结构而言。一般m062x用6-31+g(d,p)，最多6-311。就很不错了。弥散函数加太多，体系也不小。所以很难做。耗时太多，不易收敛。

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5楼2014-04-18 13:52:19
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郝玉蕾

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lkui486 at 2014-04-18 13:52:19
基组用的太大了。对于跑结构而言。一般m062x用6-31+g(d,p)，最多6-311。就很不错了。弥散函数加太多，体系也不小。所以很难做。耗时太多，不易收敛。

我尝试了用小的基组，比如6-31+g*, 也有24小时了，还没出来。。
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6楼2014-04-18 17:30:36
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rex路人

银虫 (小有名气)
★
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我用的就是这个方法，基组用的是6-311+g**,优化了接近两千个小时都没有优化出来，后来改成,6-31g*后，优化了一千多个小时才优化出来。所以大基组很费时间的

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7楼2014-04-19 10:33:17
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
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3楼: Originally posted by agent99 at 2014-04-18 07:08:36
m062x处理弱相互作用应该很不错啊。能贴出来输入文件和输出文件的末尾吗

m062x处理弱作用，说不上多好，也就比传统泛函好些。
双杂化泛函带D3校正才好
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8楼2014-04-19 10:41:23
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wanguangli

铜虫 (小有名气)
★
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8楼: Originally posted by yjcmwgk at 2014-04-19 10:41:23
m062x处理弱作用，说不上多好，也就比传统泛函好些。
双杂化泛函带D3校正才好...

什么是好 取决于标准
相对于b3lyp之流 m06系列好极了
相对于ccsdt来说 m06系列差极了
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9楼2014-04-19 15:03:09
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