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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 切出来的表面拼接成Layer时，如何才能消除界面之间的间隙
汕头大学海洋科学接受调剂
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ip0371

木虫 (正式写手)

[求助] 切出来的表面拼接成Layer时，如何才能消除界面之间的间隙 已有1人参与

如附图所示，四个红色箭头表示界面处的间隙；

这些间隙，是由三个表面拼接成为Layer时，所产生的。

我已经在构建Layer时将真空层的厚度分别设为0.0了，

但是还是在最后的界面（附图）处产生了许多不必要的空白地带，

如果将这些空白地带不处理的话，

那么在优化结构的时候将会非常的耗费时间，

效率大打折扣。

于是，我的问题就是：请有过类似经验的朋友告知您遇到时是如何解决这些空隙的（4个红色箭头所指之处）？

切出来的表面拼接成Layer时，如何才能消除界面之间的间隙
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1楼 2014-04-16 19:22:11
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖！ 2014-04-17 10:43:44
移动其中一种结构，做到跟另一个面成键，至于键长需要自己确定，然后量一下整个结构周期性长度，设置晶格常数，重新build。
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2楼2014-04-16 22:27:53
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ip0371

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-16 16:27:53
移动其中一种结构，做到跟另一个面成键，至于键长需要自己确定，然后量一下整个结构周期性长度，设置晶格常数，重新build。

按你说的方法做了。
实际情况是，胞改变，所有原子的相对位置也会发生改变，晶体就变样了。
不可行。
谢谢你！

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3楼2014-04-17 00:23:17
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ip0371 at 2014-04-17 00:23:17
按你说的方法做了。
实际情况是，胞改变，所有原子的相对位置也会发生改变，晶体就变样了。
不可行。
谢谢你！
...

胞肯定是要改变，位置是相对的，看你怎么理解。
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4楼2014-04-17 00:25:53
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sungjen

银虫 (著名写手)
楼主你好，你这样所说的消除界面之间的间隙，成功了吗？界面间的距离应该是需要优化的吧  不可能界面间距为零啊
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希望有一天成为大神
5楼2014-08-21 15:41:29
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sungjen

银虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-04-16 22:27:53
移动其中一种结构，做到跟另一个面成键，至于键长需要自己确定，然后量一下整个结构周期性长度，设置晶格常数，重新build。

移动其中一个结构，做到和另一个面成键指的是什么意思 ？是指仅仅达到一定距离还是指在图像上显示有键？界面间的距离应该是经过优化的吧 ？？
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希望有一天成为大神
6楼2014-08-21 15:43:24
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心宁

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sungjen at 2014-08-21 15:43:24
移动其中一个结构，做到和另一个面成键指的是什么意思 ？是指仅仅达到一定距离还是指在图像上显示有键？界面间的距离应该是经过优化的吧 ？？...

界面间距做个键长的平均 多次调解其数值 比如+/- 0.05 多次优化 取其最小能量的结构来做计算
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志存高远须积厚流广－坚持不懈定斗转星移！
7楼2014-09-18 11:15:37
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sungjen

银虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 心宁 at 2014-09-18 11:15:37
界面间距做个键长的平均 多次调解其数值 比如+/- 0.05 多次优化 取其最小能量的结构来做计算...

我看到的是设置不同间距 然后直接算能量的，然后找出最小的能量间距
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希望有一天成为大神
8楼2014-09-18 15:49:29
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