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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 内含子分析
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510392261

铜虫 (初入文坛)

[求助] 内含子分析 已有1人参与

我现在有一个基因sod的序列，以及一段内含子的序列，想知道这个内含子有没有功能或者可能的功能，直接一点是能不能促进sod的表达或者抑制sod的表达。请问有人能帮忙我解决这个问题吗？很苦难，很着急，谢谢各位高手了，我把我所有金币都贡献出去（太少），希望能有人帮忙解决。
内含子序列：TGTTTCTCAGTTGATGACGCCACTTTGGAAAGTGTTGGTATGTGTTGAGCGCCAAATCCGAGAGTTTACTCACTCCAGAAAATAATTTTCTTTTTGTCGAGCTGCGCCCAATAAAGTGCAAACTGTGGGTGACATTTTATACGAAAATATAAGTAATTGCGATCCAGCATGCGGAAAGTCGCCAAAATATTCTGAAAGGTAGTGACTGCCATAAAGATGATATGGGGAATTCAAAATCTCCTTGTTTATAATAGCAACACCTTCTTTGAGCTTTATTTCGACAAAAAAATCCACATTTAATGCGAGGTTTACTTTATGGCTGAATTTACAACGGAATACGTTTCCTCATAACAAATACATAAACGTTCTAGTGATTAAACTCTGTTATCCTCGGGATTCATTCCTTGCTGGCGTTCTGAAAGCGTTCGTCCACATTCTTCCAATTGGCCACCTTCCAGATGCTCTTCACGTAATCAGGGCGGACATTTTTGTATTGCAGGTAATAGGCATGCTCCCATACATCAATTCCAAAGAGAGGAACAAGTCCTGAAAGAAATTTTTAATAAAAAATCATTATGGATAATACACCCCGTTACGAAAGTATACCTACCCGCCATGGAAAATTGCAGTATCTAAGGTTTGGTAAGACATATTGAAAAACTGCTAATGCCATTCGAAAGAGCATGTCTTAAAACCTATTAACGCGTGGAATTAGCCCGTGAAAAAAAATTTTGGTCGGTTTGGCAACTATTTTAATATTTTTGGCCGTTTCAAAAGTATACCTACCCATGACGGTTTTTTGGCCAATCCTGCCCCGATTTTATTCCACAGTGTACTCTATGGTATTACGAAGTGTATCACATTCATTTCAATCGCACTTTATCCA
万分感谢
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1楼 2014-04-16 18:36:40
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qiushuimeng

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我也在研究内含子的功能，也在等帮助～握个手吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2014-04-16 19:23:16
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流, 2014-04-18 09:01:01
你试着筛选一下突变体库试试，看看在该位置突变有没有影响。
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hehe
3楼2014-04-16 20:36:41
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510392261

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-04-16 20:36:41
你试着筛选一下突变体库试试，看看在该位置突变有没有影响。

首先非常感谢你的帮助，我的意思是能否根据这段内含子序列，去分析其可能具有的功能？
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4楼2014-04-16 20:59:22
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510392261

铜虫 (初入文坛)
为啥没人回呢
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5楼2014-04-17 18:42:45
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zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流, 2014-04-18 09:01:06
表达没有内含子的，与含有内含子的看看，是否表达有变化，做个瞬时转染就可以
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6楼2014-04-17 19:13:30
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510392261

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zh10246 at 2014-04-17 19:13:30
表达没有内含子的，与含有内含子的看看，是否表达有变化，做个瞬时转染就可以

马上要毕业，没时间做实验，指望这点数据分析出东西来
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7楼2014-04-18 12:52:24
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zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 510392261 at 2014-04-18 12:52:24
马上要毕业，没时间做实验，指望这点数据分析出东西来...

其实两个星期都可以做的，当然能预测最好
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8楼2014-04-18 12:58:51
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qiushuimeng

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

我的实验已经做了表达了，也出实验结果了，但是我还是想分析下可能的原因，我从网上分析过序列上的模体，没啥能用着的，所以就想分析其他方面比如二级结构，唉，不知如何下手呀呀。你也可以先分析它的序列吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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9楼2014-04-18 23:40:23
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