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airconditioner

金虫 (正式写手)

[交流] 关于红外分峰拟合的问题,谢谢您

图为扫描的人血清白蛋白的傅立叶红外分峰拟合图

扫描结果为最外面的这个大峰,求积分面积,所以将其分成里面的各个小峰,

再分别求每个小峰的面积,一段波数范围内的小峰面积之和代表蛋白的一种二

级结构的含量,这样就可以对蛋白的各种二级结构实现定量,具体为1610-

1640cm-1为β-sheet,1640-1650cm-l为random,1650-1658cm-1为α-helix,

1660-1700cm-1为β-turn。我现在的问题是如果分峰后得到的某个小峰峰位刚好

为于1640cm-1或1650cm-1等这样的交界点上,那这个小峰的积分面积算那种二

级结构的含量呢?谢谢大家!
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yuxiaolin

金虫 (小有名气)

★ ★
dnp(金币+2,VIP+0):哈哈,谢谢应助,不知道以后可以写中文么?
Actually, it is difficult to determine the range 1640-1650 cm-1. It can be attributed from random,  intermolecular b-sheet interaction. One advice is that adding some detergent in your sample to decrease the intermolecular interaction, especially the hydrogen bond. Then run IR and fit the peak. If there is a shift for 1640 or 1650. It supposed to be  intermolecular b-sheet interaction, otherwise, it is random vibration of amide.
4楼2008-03-11 00:00:01
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airconditioner

金虫 (正式写手)

哪位朋友知道,帮帮忙啊,多谢了
2楼2008-03-06 08:12:46
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dnp

荣誉版主 (知名作家)

小木虫浪子

优秀版主

不知道诶,俺们只搞计算,不做实验。
如果可以的话到生物版块试试看……
What would Jesus do?
3楼2008-03-06 11:57:17
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ramanlxh

荣誉版主 (知名作家)

木虫007之小老虎


dnp(金币+1,VIP+0):鼓励参与讨论……
我的想法是,分峰时你可以设置某些参数,不至于出现刚好位于交界点上的峰。

比如,1610-1640cm-1为β-sheet,你就拟合出一个峰,位移这个范围内,其它组分亦然。 当然,这样拟合出的峰叠加起来会与大峰稍有偏差。
PCB药水
5楼2008-03-11 08:40:34
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