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zkk1222铁杆木虫 (著名写手)
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[求助]
分子对接的翻译，求大神帮帮忙吧。谢谢了。大神走过路过不要错过啊~小虫一直再等呢
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图1是MAO-B与化合物1、2的作用模式图，配体与口袋的相互作用以疏水作用为主。 化合物1和2共同作用的氨基酸有Phe168、Leu171、Cys172、Ile198、Ile199、Gln206、Tyr326(图中绿色的氨基酸残基)，其中化合物2分别与Ile99、Gln206形成了氢键作用。化合物1中，接入的降碳倍半萜单元与口袋中的其他氨基酸残基发生了额外的疏水作用，这些残基包括Pro102、Phe103、Leu164、Leu67、Ile316(图中黄色的氨基酸残基)，其中化合物2与Pro102形成了氢键作用。 翻译上面一部分也行！谢啦。各位大神你们自己看上面的，基本全是氨基酸的缩写，那些都不用翻译的。 下面的比较复杂了，如果翻译不了还是谢谢了。 谢谢了 2014041012.20-201404101906 分别比较化合物1、2与MAO-A、MAO-B的对接模式可知，降碳倍半萜单元的引入造成分子的体积和表面积明显增大。在与单胺氧化酶口袋作用时，两个配体与口袋的作用都是以疏水作用为主，化合物1中的降碳倍半萜单元与额外的疏水腔形成了相互作用，导致配体1与口袋的结合能力增强。另一方面，较大取代基的引入，口袋对化合物1的挤压，使化合物1整体向FAD靠近，因而造成它与FAD的结合更为紧密。因此会在实验上发现化合物1接入降碳倍半萜单元后活性提高了几倍。这一点从下表对接的结合自由能也能看出。 |
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【答案】应助回帖
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zkk1222: 金币+20, 翻译EPI+1, ★★★很有帮助, 谢谢你啦~~十分感谢！！！！！！！ 2014-04-11 16:47:57
zkk1222: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 还是感谢，不知道下面的那段，您能否看看。还是感谢。 2014-04-11 16:49:37
zkk1222: 金币+20, 翻译EPI+1, ★★★很有帮助, 谢谢你啦~~十分感谢！！！！！！！ 2014-04-11 16:47:57
zkk1222: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 还是感谢，不知道下面的那段，您能否看看。还是感谢。 2014-04-11 16:49:37
| Figure 1 is the schematic diagram of MAO-B and compound 1 or 2 ,which showed that the interaction between the ligand and the pocket are mainly hydrophobic interactions. All the amino acid that interacted with both compounds 1 and 2 are Phe168, Leu171, Cys172, Ile198, Ile199, Gln206, Tyr326 (amino acid residues in green ) and compound 2 formed hydrogen bonds with Ile99 and Gln206 .While additional hydrophobic effect occured between compound 1 carbon reduction sesquiterpene access unit and other amino acid residues in the pocket which included Pro102, Phe103, Leu164, Leu67, Ile316 ( amino acid residues in yellow ) ,at the same time , compound 2 formed hydrogen bonds with Pro102. |
2楼2014-04-10 21:12:17
