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jia0472

金虫 (小有名气)

[交流] 菌种鉴定

想问大家，关于菌种鉴定都需要做哪些工作？
目前我正在做一个厌氧菌的分离，如果最终分离能够得到一个纯的菌株，接下来该通过什么方法来把该菌株鉴定到属呢？
另外这个菌株厌氧，对于它的鉴定方法是否和常规的鉴定方法不一样呢？实在是很困惑
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1楼 2008-03-01 16:26:19
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yaoyl0679

金虫 (正式写手)
★
reasonspare(金币+1,VIP+0):xiexie 欢迎常来,.
如果单的是只要知道这个菌属于哪个属的话,只要提取一下基因组DNA,然后扩增16s rDNA测序,在NCBI上比对就可以知道这个菌是属于那个属了,而进一步可以做一些生理生化的鉴定工作.这些可以参考东秀珠的细菌鉴定手册.
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2楼2008-03-01 16:46:28
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yaoyl0679

金虫 (正式写手)
★
reasonspare(金币+1,VIP+0):xiexie,
如果你需要进一步知道属于那个种的话,那目前广泛受到认可的方法就是基因组杂交,这个需要买标准菌株.
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3楼2008-03-01 16:48:03
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steven689

木虫 (著名写手)
pcr 然后测序，然后同源性比对，最简单、省事
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4楼2008-03-02 14:37:42
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raftsman

铜虫 (正式写手)
我也筛选了一个真菌，作了个ITS扩增，测序之后在ncbi比对后，发现同源性都比较低，看来还是要用形态学鉴定，但是我不知道怎么弄了 。基础差啊！
帮忙啊
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5楼2008-03-02 17:55:16
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dreamsail

银虫 (正式写手)
俺做的时候:格兰氏染色,细胞色素氧化酶,然后选择API试剂条.假如反应不够,可以补充,或者做16s.
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6楼2008-03-03 00:58:14
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sinbart

过程

纯化的菌株—染色特性和培养特性观察——生化鉴定——PCR（16sRNA基因）——比对（最好用标准株的序列比对）
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7楼2008-03-03 08:50:04
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