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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » [讨论]复杂体系-构效关系
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

[交流] [讨论]复杂体系-构效关系

有时候，像高分子、催化剂、生物制剂等体系，没办法从分子结构直接获取结构参数（Descriptor）来进行构效关系研究。

在这种情况下，不妨采用其他的办法，例如光谱、色谱、极谱、共振谱、衍射谱，甚至电泳、电镜等方法，目的是能够表征一系列相关体系的特征。

核磁共振，完全可以用化学位移的变化作为Descriptor。
色谱，则可以选择保留时间。

只要能找出Descriptor这些变量（依结构/组成不同而变化的自变量）与所研究的体系某种性能/活性之间的数学关系，就是QSAR。

思考一下，不管体系有多么复杂，既然作为一个系列的若干体系（如某种组分有所改变），那么在一定范围内，这种变化与体系的整体复杂背景之间没有太大关系。换句话说，大家都很复杂，那么就可以不考虑这个复杂性，而专注于变化的部分。

就像青蛙，只能看见运动的物体。

[ Last edited by zzgyb on 2008-2-26 at 09:08 ]
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1楼 2008-02-26 00:22:13
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whitewatercn

银虫 (小有名气)
说起复杂体系,不能不说到"中药",
这方面的研究在中药界还是开展得比较多的,称为"谱效关系","指纹图谱" 等等...
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2楼2008-02-26 15:39:43
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
QSAR无处不在
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3楼2008-02-26 18:12:50
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lqz0614

木虫 (小有名气)
非常感谢lz！也就是说以吸附剂吸附前后发生变化的官能团作为自变量，以吸附效率作为因变量构建数学模型能够实现，能否详细介绍一下构建模型的方法？这种构建模型能够使用用软件吗？
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4楼2008-02-27 20:54:30
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
那你就要好好学习一些统计学了。
软件太多了，SAS, SPSS, MatLab, JMP, Octave, SciLab....Excel。
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5楼2008-02-27 22:31:21
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yelverxm

金虫 (小有名气)
但是象色谱，核磁等对于传统药物开发也是用不来吧，复杂体系的我也接触不多。

不过以前看过一篇混合物QSAR的研究，好像作者是将descriptor计算出来然后加权后得混合物的‘descriptor’。

会不会有其他的办法来做混合物QSAR? 我是还没想清楚哦
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In God we trust
6楼2008-02-27 23:06:10
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
元素们就是QSAR
QSAR是化学的本质

不管研究的体系多复杂
只要找出“自变量”和“因变量”
剩下的就是数学关系。
最后，再盖个“解释”（不是“结实”）的帽儿。

不只是化学，经济、金融、管理......都有QXYR。
至于X、Y是啥，是啥，还是那啥，嘻嘻，......有劳了。
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7楼2008-02-27 23:18:39
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yelverxm

金虫 (小有名气)
这是不是说QSAR/QSPR发展的方向只能是横向的呢？而对于药物设计，此技术还有发展的空间吗？

前些天和国外某老师聊，他说QSPR已经outdated了啊。descriptor 虽然3000多了，但是对于具体的研究还是没有很effective的，而算法象SVM，ANN等又都是黑箱子一个。

不知道前辈如何看这问题？
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In God we trust
8楼2008-02-27 23:54:14
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
俺说过：QSAR is DEAD!
拜托你搜索一下吧。
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9楼2008-02-28 00:46:49
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