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【讨论】集思广益 做大模拟
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各位XDJM大家好: 由于大家各自使用MS的模块不一样 目的也不尽相同 我们对软件的熟悉也不是那么全面 在此发帖 希望各位XDJM 把各自的使用模块去计算出的物理测量量和简单的设置方法写写 这样我们就能快捷的上手去使用多种模块 发挥MS的强大功能 （castep 除外  ）由于我们各自的计算主题不一样 所以请你们尽管放心 不会引起相互之间的竞争 [search]把模拟发扬光大(无奈之下)[/search] 如果你已经在某处发过了 请复制个网址 链接一下 谢谢交流 [ Last edited by 心宁 on 2009-2-20 at 16:08 ] |
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csfn
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2楼2008-02-26 09:27:53
”看来瞎子见钱眼睁开“ 不灵啊3楼2008-02-26 13:04:39
chongzi728
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4楼2008-02-26 17:02:32
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心宁(金币+1,VIP+0):写的挺好
fegg7502(金币+5,VIP+0):thank you very much! 2-23 19:04
心宁(金币+1,VIP+0):写的挺好
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看看中国科技大学杨金龙教授的学生博士论文中的概述： Material Studio（MS，http://www.accelrys.com/）。MS 是一个专门 的材料模拟和建模的平台，它包括两个密度泛函计算模块，DMol3 和 CASTEP。DMol3 采用数值原子轨道基函数，并且采用Hartree 势的多级 展开方法，因此DMol3 的计算速度较快。虽然它的精度不如Gaussian，但 是由于它计算速度较快，且可以自动判断体系的能量最低的自旋多重度， 因此常可以用其计算结果作为初步结果，以供Gaussian 做进一步计算。 而且，由于计算量不大，DMol3 可以用于更大体系的计算。DMol3 以前的 版本主要是用来模拟分子体系，而当前的版本加入了周期性边界条件的处 理，也可用来计算固体。CASTEP 的平面波赝势方法是一种经典的算法， 有很高的精度。 VASP（http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/Welcome.html） 。VASP 的 全称是“ 维也纳从头计算模拟包” ， 它就是基于上面提到的 CASTEP（1989版）开发的。VASP 是用平面波赝势方法进行分子动力 学模拟的软件包。主要用于具有周期性的晶体或表面的计算，但通过采用 大单胞，也可以用于处理小的分子体系。与同类的软件相比，它比较早 地实现了超软赝势，计算量相对于一般的模守恒赝势方法大为减少。最 近，VASP 又加入了对PAW方法的支持，使之应用范围更加广泛。 WIEN（http://www.wien2k.at/）。WIEN 用密度泛函理论计算固体 的电子结构，最新版本为WIEN 2000。它基于键结构计算最准确的方 案全势（线性）缀加平面波（(L)APW）和局域轨道方法。在密度 泛函中可以使用L(S)DA，GGA，或者LDA+U。WIEN 2000使用全电子方 案，包含相对论影响。可以计算固体的多种性质。 ADF（http://www.scm.com/）。ADF 即“阿姆斯特丹密度泛函”，是一个历史悠久的密度泛函软件包。它可以比较好地处理重元素的相对论 效应；含有包括最新的meta-GGA 在内的多种交换相关泛函形式；它的片 断分析法直观方便。 PWSCF（http://www.pwscf.org/）。PWSCF 也是一个赝势平面波软 件包，它支持模守恒和超软两种赝势。PWSCF 的特点是较好的实现了密度 泛函微扰理论，这使得它可以比较方便地用来计算固体的声子色散谱等性 质。另外，PWSCF 是一个GNU 自由软件，可从互联网上免费下载，且不 断有新的工具提供。 SIESTA（http://www.uam.es/departamentos/ ... r;smateriac/siesta/）。 该软件包的目标是用线性标度的算法做数千原子的电子结构模拟。它使 用数值原子基组和模守恒赝势，在实空间网格上计算Hartree 和交换相关 势。SIESTA 不是自由软件，但是用于学术用途可以通过联系作者免费获 取。 ABINIT（http://www.abinit.org/）。ABINIT 是使用赝势平面波进行 计算的软件包，只支持模守恒赝势。它可以用来计算电子结构、点阵 动力学，也可以用TDDFT（对分子体系）和GW 两种方法计算激发 态。ABINIT 的另一个特点是它是电子结构计算领域中一个典型的自由软件 项目。它遵循GNU GPL 许可协议，它的开发团队是Xavier Gonze 领导的 来自世界各地的志愿者，它甚至象Linux 内核一样保持着两套开发版本。 CPMD（http://www.cpmd.org/）。CPMD 是一个Car-Parrinello 分子 动力学程序包。它也基于平面波赝势框架，支持模守恒和超软两种赝 势。CPMD 软件中包括自由能密度泛函、路径积分分子动力学和meta- dynamics 等方法。它可以计算响应函数、激发态和其他许多电子性 质。CPMD 免费提供给非盈利性组织。 OCTOPUS（http://www.tddft.org/programs/octopus/）。OCTOPUS 是一个实空间含时密度泛函理论软件包。它在实空间表示波函数，用有限 差分来表示动能。由于包括含时方法，它可以用来方便地模拟各种光谱、 计算激发态和处理外电场甚至外磁场中的体系。可免费下载。 各种计算软件层出不穷， 这里介绍的只是其中很少的几个， 更多的计算软件方面的信息可以访问量子化学软件中文网 （http://zorkov.nease.net/）。不同的软件包各有所长，因此需要在了解 的基础上，选择使用。 |
6楼2008-02-29 16:25:08
7楼2008-03-01 11:52:39
比较 （抄的）Castep ＆ vasp
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fegg7502(金币+3,VIP+0):鼓励交流！ 2-23 16:24
fegg7502(金币+3,VIP+0):鼓励交流！ 2-23 16:24
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Castep: PW + Norm conserving PP or Ultrasoft PP vasp: PW + Ultrasoft PP or PAW potential -- 1,vasp的pseudopotenital库要比castep的完整。 2,计算磁性vasp也要比castep的好，能处理好几种特殊的情况，比如： Non-collinear calculations 和spin orbit coupling vasp实现了L(S)DA+U或GGA+U， VASP还在MD方面的能力要比Castep强大的多，而且也好不逊色于CPMD。 （记得那个文献有提到说，vasp在对金属体系做MD要好于CPMD，在对半导体或绝缘体 体系做MD也与CPMD不相上下） 3,vasp可调参数多,计算速度较castep快,并行方便效率高.价格方面,vasp比castep低了一个层次.castep每增加一个cpu都需要钱,vasp则没有这个费用呢. 4,Castep的一个好处，是实现在Material Studio中，数据库强大,建模和画图很方便。我经常用他 建模以及参考下他默认的计算参数。 5,castep有winds版本和 linux版本,winds版本界面友好,操作简单,鼠标点点好象容易上手.比较适合做实验的人做辅助计算.不过据说vasp马上也将由media公司推出友好界面的vasp.也结合了多个模块,值得期待~ 6, Castep能计算声子色散曲线（好像只能采用Norm conserving PP）。其实vasp也可以，不过要结合其他的一个程序PHONON(可这个程序要money,已经在友好界面化的vasp中,不过增加这个模块另外要 money）。 7,castep由北京创腾代理,vasp由北京宏剑代理,有兴趣的了解更具体可以咨询下~ (部分参考紫霞valenhou所发帖 ) |
8楼2008-03-01 12:04:49
9楼2009-02-20 16:09:55
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10楼2009-02-20 16:15:41