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nima0332

银虫 (小有名气)

[求助] 可以帮忙排查一下高斯D01安装过程中出现的错误吗,不胜感激! 已有2人参与

小弟不才,因要用到DFT-D需安装D01版本的高斯,但时隔多日,仍然无法成功安装,无奈何绝望之中,再次向各位求教:

安装步骤:
一、        解压缩:
用户名:gyy   压缩包:gaosi09di01.zip
复制gaosi09di01.zip到/home/gyy,执行unzip gaosi09di01.zip
将解压后的文件夹改名为g09
进入g09文件夹,新建scratch文件夹
二、        修改权限:
新建用户组ABC,将gyy用户添加到ABC用户组
su root,执行:
sudo chgrp –R ABC /home/gyy/g09
sudo chmod –R 770 /home/gyy/g09
su gyy
进入g09文件夹,执行:
./bsd/install
三、        修改环境变量
进入gyy,执行:
vi .bashrc
在文件末尾添加:
g09root=/home/gyy
GAUSS_SCRDIR=/home/gyy/g09/scratch
Export g09root GAUSS_SCRDIR
. $g09root/g09/bsd/g09.profile
退出插入模式,wq保存,后执行:
Source /home/gyy/.bashrc

四、        完成安装
执行输入文件,数秒后高斯出现错误提示并终止计算;
Segmentation violation
———trace not available
如图:


全程安装没有出现错误提示,没有环境变量错误提示,ls –al后查看权限显示正常;
gjf文件在windows版本GaussView5.08上制作,可以在A、B版本上正常计算;
用该方法可以正常安装和运行A版本和B版本的gaussian;
用该方法安装三个不同来源的gaussianD01,出现同样错误;
在三台不同电脑(两台Intel,一台AMD)上,按照该方法安装,出现同样错误;
在centOS6.0、6.5和小红帽6.2等版本的linux下,按照该法安装,出现同样错误;

其中D01版本的gaussian安装包两个来自http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6882616&fpage=1 另一个是sob老师提供http://pan.baidu.com/s/1jGyVnbK  安装包均在linux下用unzip或unrar解压,没有错误提示。
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仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nima0332: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-03-28 14:47:16
据说 仅仅是据说
g09D01不再是纯fortran编的
改成c+fortran混合编程了
所以你需要升级你的gcc
嗯 据说就是这样子的

我的环境变量
CODE:
export g09root=/home/g
export GAUSS_SCRDIR=/home/g/tmp
export GAUSS_EXEDIR=/home/g/g09/bsd/
source $g09root/g09/bsd/g09.profile

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2014-03-26 17:34:54
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豆豆sk8

银虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by nima0332 at 2014-04-02 19:38:07
谢谢~我改了g09 文件夹的权限了~

命令是这样的么:chmod -R 770 g09   .   
g09是文件夹还是命令啊(-R好像是包括文件夹下的子文件夹的意思。。);
命令后面有那个“ ." 么?
我试试看~...

g09是指的这个文件夹,没有后面的点~再试试看
Justskate
14楼2014-04-03 09:08:35
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普通回帖

黄金比例

木虫 (正式写手)

哎,无语。。。。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2014-03-25 15:21:59
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schalke

至尊木虫 (著名写手)

记得前几天好像问过。。。你只输入g09看看输出什么结果
3楼2014-03-25 15:50:54
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nima0332

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by schalke at 2014-03-25 15:50:54
记得前几天好像问过。。。你只输入g09看看输出什么结果

显示进入高斯;ctrl+D,结束以后,出现相同的错误提示。
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
4楼2014-03-25 15:57:52
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nima0332

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-25 15:21:59
哎,无语。。。。

真的不是输入命令的问题,大哥,我试过了,效果一样的~
   
我最后怀疑是自己的环境变量可能设置存在问题,您设置的环境变量可以发给我么?谢谢。。
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
5楼2014-03-25 16:59:51
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lzl8181

铁杆木虫 (著名写手)

单身浏览汉

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+1 2014-03-26 10:57:21
nima0332: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-03-28 14:47:25
看一下log文件有没有出错信息,是不是出现了...word wide...权限过大的提示?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

版权乜有,盗用不究!
6楼2014-03-26 10:41:03
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nima0332

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by lzl8181 at 2014-03-26 10:41:03
看一下log文件有没有出错信息,是不是出现了...word wide...权限过大的提示?

真心感谢,打算退而求其次,暂时先不用色散矫正了。谢谢您!
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
8楼2014-03-28 14:41:50
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nima0332

银虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by yjcmwgk at 2014-03-26 17:34:54
据说 仅仅是据说
g09D01不再是纯fortran编的
改成c+fortran混合编程了
所以你需要升级你的gcc
嗯 据说就是这样子的

我的环境变量
export g09root=/home/g
export GAUSS_SCRDIR=/home/g/tmp
export GAUSS_ ...

谢谢小卒老师!打算联系高斯公司问问。。先不用色散矫正了,用其他文献上的方法算算~这段时间焦头烂额,等问题慢慢解决了,定然整理一些新手心得发出来。。
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
9楼2014-03-28 14:46:12
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
9楼: Originally posted by nima0332 at 2014-03-28 14:46:12
谢谢小卒老师!打算联系高斯公司问问。。先不用色散矫正了,用其他文献上的方法算算~这段时间焦头烂额,等问题慢慢解决了,定然整理一些新手心得发出来。。...

你这样折腾下去 似乎太耗时
你不如采用一个“一劳永逸”的方式
把《鸟哥的私房菜基础学习篇》读一遍再搞吧
读这本书时候,你一定会问“这些知识对我有用吗”?
直到读完了你才能发现这些知识的用途
10楼2014-03-29 11:18:59
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