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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 可以帮忙排查一下高斯D01安装过程中出现的错误吗，不胜感激！
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nima0332

银虫 (小有名气)

[求助] 可以帮忙排查一下高斯D01安装过程中出现的错误吗，不胜感激！ 已有2人参与

小弟不才，因要用到DFT-D需安装D01版本的高斯，但时隔多日，仍然无法成功安装，无奈何绝望之中，再次向各位求教：

安装步骤：
一、        解压缩：
用户名：gyy   压缩包：gaosi09di01.zip
复制gaosi09di01.zip到/home/gyy，执行unzip gaosi09di01.zip
将解压后的文件夹改名为g09
进入g09文件夹，新建scratch文件夹
二、        修改权限：
新建用户组ABC，将gyy用户添加到ABC用户组
su root，执行：
sudo chgrp –R ABC /home/gyy/g09
sudo chmod –R 770 /home/gyy/g09
su gyy
进入g09文件夹，执行：
./bsd/install
三、        修改环境变量
进入gyy，执行：
vi .bashrc
在文件末尾添加：
g09root=/home/gyy
GAUSS_SCRDIR=/home/gyy/g09/scratch
Export g09root GAUSS_SCRDIR
. $g09root/g09/bsd/g09.profile
退出插入模式，wq保存，后执行：
Source /home/gyy/.bashrc

四、        完成安装
执行输入文件，数秒后高斯出现错误提示并终止计算；
Segmentation violation
———trace not available
如图：


全程安装没有出现错误提示，没有环境变量错误提示，ls –al后查看权限显示正常；
gjf文件在windows版本GaussView5.08上制作，可以在A、B版本上正常计算；
用该方法可以正常安装和运行A版本和B版本的gaussian；
用该方法安装三个不同来源的gaussianD01，出现同样错误；
在三台不同电脑（两台Intel，一台AMD）上，按照该方法安装，出现同样错误；
在centOS6.0、6.5和小红帽6.2等版本的linux下，按照该法安装，出现同样错误；

其中D01版本的gaussian安装包两个来自http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6882616&fpage=1 另一个是sob老师提供http://pan.baidu.com/s/1jGyVnbK  安装包均在linux下用unzip或unrar解压，没有错误提示。
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
1楼 2014-03-25 11:34:39
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
nima0332: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-03-28 14:47:16
据说 仅仅是据说
g09D01不再是纯fortran编的
改成c+fortran混合编程了
所以你需要升级你的gcc
嗯 据说就是这样子的

我的环境变量
CODE:
export g09root=/home/g
export GAUSS_SCRDIR=/home/g/tmp
export GAUSS_EXEDIR=/home/g/g09/bsd/
source $g09root/g09/bsd/g09.profile
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

nima0332
7楼2014-03-26 17:34:54
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豆豆sk8

银虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by nima0332 at 2014-04-02 19:38:07
谢谢~我改了g09 文件夹的权限了~

命令是这样的么：chmod -R 770 g09   .   
g09是文件夹还是命令啊（-R好像是包括文件夹下的子文件夹的意思。。）；
命令后面有那个“ ." 么？
我试试看~...

g09是指的这个文件夹，没有后面的点~再试试看
赞一下(1人) 回复此楼
Justskate
14楼2014-04-03 09:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

黄金比例

木虫 (正式写手)
哎，无语。。。。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2014-03-25 15:21:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

schalke

至尊木虫 (著名写手)
记得前几天好像问过。。。你只输入g09看看输出什么结果
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3楼2014-03-25 15:50:54
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nima0332

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by schalke at 2014-03-25 15:50:54
记得前几天好像问过。。。你只输入g09看看输出什么结果

显示进入高斯；ctrl+D，结束以后，出现相同的错误提示。
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
4楼2014-03-25 15:57:52
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nima0332

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-25 15:21:59
哎，无语。。。。

真的不是输入命令的问题，大哥，我试过了，效果一样的~
   
我最后怀疑是自己的环境变量可能设置存在问题，您设置的环境变量可以发给我么？谢谢。。
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
5楼2014-03-25 16:59:51
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lzl8181

铁杆木虫 (著名写手)

单身浏览汉

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+1 2014-03-26 10:57:21
nima0332: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-03-28 14:47:25
看一下log文件有没有出错信息，是不是出现了...word wide...权限过大的提示？
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

nima0332
版权乜有，盗用不究！
6楼2014-03-26 10:41:03
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nima0332

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by lzl8181 at 2014-03-26 10:41:03
看一下log文件有没有出错信息，是不是出现了...word wide...权限过大的提示？

真心感谢，打算退而求其次，暂时先不用色散矫正了。谢谢您！
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
8楼2014-03-28 14:41:50
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nima0332

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by yjcmwgk at 2014-03-26 17:34:54
据说 仅仅是据说
g09D01不再是纯fortran编的
改成c+fortran混合编程了
所以你需要升级你的gcc
嗯 据说就是这样子的

我的环境变量
export g09root=/home/g
export GAUSS_SCRDIR=/home/g/tmp
export GAUSS_ ...

谢谢小卒老师！打算联系高斯公司问问。。先不用色散矫正了，用其他文献上的方法算算~这段时间焦头烂额，等问题慢慢解决了，定然整理一些新手心得发出来。。
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
9楼2014-03-28 14:46:12
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
引用回帖:
9楼: Originally posted by nima0332 at 2014-03-28 14:46:12
谢谢小卒老师！打算联系高斯公司问问。。先不用色散矫正了，用其他文献上的方法算算~这段时间焦头烂额，等问题慢慢解决了，定然整理一些新手心得发出来。。...

你这样折腾下去 似乎太耗时
你不如采用一个“一劳永逸”的方式
把《鸟哥的私房菜基础学习篇》读一遍再搞吧
读这本书时候，你一定会问“这些知识对我有用吗”？
直到读完了你才能发现这些知识的用途
赞一下 回复此楼
10楼2014-03-29 11:18:59
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