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glssg

木虫 (正式写手)

[求助] 用蛋白ID在基因库里提取出相应序列的程序 已有1人参与

我这有个.tab文件,里面记录了蛋白的ID。
         A                   B
1      …………topic…………
2   #proteinid      ……
3    99641          ……
4    100524        ……
5    539761        ……
6    99638          ……
………………………………

用EXCEL打开就是上面这个样子。(我不会上图片

另外就是FASTA格式的蛋白库了,我想把对应ID的蛋白序列提取出来,怎么弄?2000+个ID

>jgi|……|503463|fgen……………50.1
MERYQKLEK……………………TENQ*

上面是Fasta格式的序列,用文本打开这样子的


我看了几天perl ,还没学会,但是这个比较急,希望大神帮忙。
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不安于现在而又安于现在
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libralibra

至尊木虫 (著名写手)

骠骑将军

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
glssg: 金币+10, 有帮助, 谢谢 支持 2014-03-26 15:49:59
这种文本操作,python非常方便
matlab/VB/python/c++/Java写程序请发QQ邮件:790404545@qq.com
2楼2014-03-25 18:09:16
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glssg

木虫 (正式写手)

我找了个现实中的大神 问题已经解决 这金币怎么办??
不安于现在而又安于现在
3楼2014-03-26 15:51:26
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