24小时热门版块排行榜    

查看: 1417  |  回复: 2

glssg

木虫 (正式写手)

[求助] 用蛋白ID在基因库里提取出相应序列的程序 已有1人参与

我这有个.tab文件,里面记录了蛋白的ID。
         A                   B
1      …………topic…………
2   #proteinid      ……
3    99641          ……
4    100524        ……
5    539761        ……
6    99638          ……
………………………………

用EXCEL打开就是上面这个样子。(我不会上图片

另外就是FASTA格式的蛋白库了,我想把对应ID的蛋白序列提取出来,怎么弄?2000+个ID

>jgi|……|503463|fgen……………50.1
MERYQKLEK……………………TENQ*

上面是Fasta格式的序列,用文本打开这样子的


我看了几天perl ,还没学会,但是这个比较急,希望大神帮忙。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

不安于现在而又安于现在
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

libralibra

至尊木虫 (著名写手)

骠骑将军

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
glssg: 金币+10, 有帮助, 谢谢 支持 2014-03-26 15:49:59
这种文本操作,python非常方便
matlab/VB/python/c++/Java写程序请发QQ邮件:790404545@qq.com
2楼2014-03-25 18:09:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

glssg

木虫 (正式写手)

我找了个现实中的大神 问题已经解决 这金币怎么办??
不安于现在而又安于现在
3楼2014-03-26 15:51:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 glssg 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +4 瞬息宇宙 2026-08-10 4/200 2026-08-10 10:23 by allmydream
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +6 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-10 09:37 by xter9665
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +8 Lanmanbaby 2026-08-09 15/750 2026-08-10 08:54 by 医学老男孩
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +15 且听虎啸 2026-08-07 22/1100 2026-08-09 22:13 by 布布和一二
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +10 布布和一二 2026-08-08 21/1050 2026-08-09 17:21 by 天神眷顾
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 5/250 2026-08-08 21:54 by 13586093586
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见