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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 相平衡模拟-丁烯的二面角参数问题
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豆豆sk8

银虫 (小有名气)

[求助] 相平衡模拟-丁烯的二面角参数问题

最近用towhee做相平衡模拟，其中用到丁烯醛，因此需要使用丁烯醛的二面角键参数，其中一个就是C-C=C-C二面角。
力场中自带了trans- C-C=C-C的二面角参数，公式形式为1： Utorsion(φ) = torcoeff(0) * [φ - torcoeff(1)]^2。但是投任务的时候根本就不行，显示错误。
通过手动修改，把这个公式形式换成 11：Utorsion(φ) = torcoeff(0) + torcoeff(1)*[1 + Cos(φ)] + torcoeff(2)*[1 - Cos(2φ)] + torcoeff(3)*[1 + Cos(3φ)]就能计算了。
请问有没有大神也遇到这种情况，用力场自带的丁烯二面角能算么？
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Justskate
1楼 2014-03-22 20:19:21
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豆豆sk8

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gx730 at 2014-03-24 14:47:36
给你顶一下 别沉了

还是肖肖好....这个目前没有想到别的好办法。我直接刚性扫描这个二面角的扭转能，结果双峰非常的不好看，是那种带尖的，所以想着如果能用原力场肯定还是原力场的准确（原力场公式做出的图只有一个峰...貌似被称为刚性模型？）。但是原力场的键参数用不了........不过没有别的办法的话就再进行一次柔性扫描，如果扫描出来的图还是那么纠结的话再另想办法吧...
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Justskate
4楼2014-03-24 20:54:39
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豆豆sk8

银虫 (小有名气)
木有人么？自己坐沙发....
赞一下 回复此楼
Justskate
2楼2014-03-24 08:31:28
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gx730

金虫 (正式写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-24 19:12:58
给你顶一下 别沉了
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3楼2014-03-24 14:47:36
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