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cuso4852cuoh

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xujc1983 at 2016-07-07 16:42:10
bond_style       harmonic
angle_style      harmonic
pair_style       lj/charmm/coul/charmm 16.0 18.0 16.0 18.0
bond_coeff       1 2000.0 1.1491     # CO2:C-O
angle_coeff      1 147.75 174.2      ...

楼主,楼主,看到请回复,我建CO2的都分家了是怎么回事啊?
11楼2018-11-14 21:21:41
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cuso4852cuoh

新虫 (小有名气)

楼主楼主,你这个不用shake,用的 restrain,我想问我用的shake,控压不行,但是你这 restrain就可以了,但是不能加kspace_style    ewald 0.0001 这个力场了,还有这个bond_coeff       1 2000.0 1.1491     # CO2:C-O
angle_coeff      1 147.75 174.2      # CO2:O-C-O参数怎么选的啊?我看的例子里面写的是bond_coeff      1       0       1.16   
angle_coeff     1       0       180 是这个
12楼2019-01-03 19:53:27
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浪费223

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xujc1983 at 2016-07-08 11:01:08
说实话,我也忘记了...

楼主的势函数有问题,charmm是描述高聚物,一般用在生物大分子上。不知道楼主当初为什么这样选,不理解,搞不懂。另外EPM-2到底选用哪个势函数,有没有大佬晓得 ?、如果还有其他适合CO2的势函数,望告知
13楼2020-03-17 19:06:53
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