24小时热门版块排行榜    

查看: 717  |  回复: 0

xueshichuan

新虫 (初入文坛)

[求助] 运行pw-gpu 结果好像不正确 个人也不会读输出文件 不清楚具体含义 请大神指点

输入文件:
&control
   calculation = 'vc-relax'
   prefix='Na2Fe2As2O',
   pseudo_dir ='/home/jin/projects/asc14/suanli/test2/workload1/workload2-upf'
   outdir='./tmp'
        etot_conv_thr = 1.0E-5 ,
        forc_conv_thr = 1.0D-4
   tprnfor=.TRUE.
   disk_io='none'
/
&system
   ibrav=7,
   celldm(1) =7.691188393, celldm(3)=3.756265356,
   nat=7, ntyp=5,
   ecutwfc=40, ecutrho=480,
   occupations='smearing',smearing='gaussian',degauss=0.002,
   nspin=2
   starting_magnetization(2)=0.125
   starting_magnetization(3)=-0.125
!  nbnd=35
!  lda_plus_u=.TRUE.
!  Hubbard_U(2)=6.0
/
&electrons
   electron_maxstep=300
   mixing_beta = 0.3
   conv_thr =  1.0d-10
/
&ions
  bfgs_ndim= 3,
  ion_dynamics='bfgs'
  pot_extrapolation = 'second_order' ,
  wfc_extrapolation = 'second_order'
/
&CELL
  cell_dynamics = 'bfgs'
/
ATOMIC_SPECIES
Na   22.99  Na.pw91-sp-van_ak.UPF
Fe1  55.845 Fe.pw91-sp-van_ak.UPF
Fe2  55.845 Fe.pw91-sp-van_ak.UPF
As   74.92  As.pw91-n-van.UPF
O     16.00  O.pw91-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {angstrom}      
Na      0.0000000000     0.0000000000     4.7989032000
Na      0.0000000000     0.0000000000    10.4890968000
Fe1     0.0000000000    -2.0350000000     7.6440000000
Fe2     2.0350000000     0.0000000000     7.6440000000
As      0.0000000000     0.0000000000     1.8529056000
As      0.0000000000     0.0000000000    13.4350944000
O       0.0000000000     0.0000000000     7.6440000000
K_POINTS {automatic}
4 4 4 1 1 1
npool=2


输出文件:

     *******************************************************************

       GPU-accelerated Quantum ESPRESSO (svn rev. unknown)
       (parallel: Y , MAGMA : N )

     *******************************************************************


     Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on 18Mar2014 at 15:52:45

     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
     for quantum simulation of materials; please cite
         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
          URL http://www.quantum-espresso.org",
     in publications or presentations arising from this work. More details at
     http://www.quantum-espresso.org/quote.php

     Parallel version (MPI & OpenMP), running on     128 processor cores
     Number of MPI processes:                 4
     Threads/MPI process:                    32
     R & G space division:  proc/nbgrp/npool/nimage =       4

     Current dimensions of program PWSCF are:
     Max number of different atomic species (ntypx) = 10
     Max number of k-points (npk) =  40000
     Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3
     Reading input from qe-workload/workload1/relax.in
Warning: card NPOOL=2 ignored
     Message from routine iosys:
     pot_extrapolation='second_order' not available, using 'atomic'
     Message from routine iosys:
     wfc_extrapolation='second_order' not available, using 'atomic'

     Subspace diagonalization in iterative solution of the eigenvalue problem:
     a serial algorithm will be used


     Parallelization info
     --------------------
     sticks:   dense  smooth     PW     G-vecs:    dense   smooth      PW
     Min        1094     363    109                37881     7256    1191
     Max        1095     364    110                37883     7275    1192
     Sum        4379    1455    437               151529    29071    4767



     bravais-lattice index     =            7
     lattice parameter (alat)  =       7.6912  a.u.
     unit-cell volume          =     854.4893 (a.u.)^3
     number of atoms/cell      =            7
     number of atomic types    =            5
     number of electrons       =        66.00
     number of Kohn-Sham states=           40
     kinetic-energy cutoff     =      40.0000  Ry
     charge density cutoff     =     480.0000  Ry
     convergence threshold     =      1.0E-10
     mixing beta               =       0.3000
     number of iterations used =            8  plain     mixing
     Exchange-correlation      =  SLA  PW   GGX  GGC ( 1 4 2 2 0)
     EXX-fraction              =        0.00
     nstep                     =           50


     celldm(1)=   7.691188  celldm(2)=   0.000000  celldm(3)=   3.756265
     celldm(4)=   0.000000  celldm(5)=   0.000000  celldm(6)=   0.000000

     crystal axes: (cart. coord. in units of alat)
               a(1) = (   0.500000  -0.500000   1.878133 )  
               a(2) = (   0.500000   0.500000   1.878133 )  
               a(3) = (  -0.500000  -0.500000   1.878133 )  

     reciprocal axes: (cart. coord. in units 2 pi/alat)
               b(1) = (  1.000000 -1.000000  0.000000 )  
               b(2) = (  0.000000  1.000000  0.266222 )  
               b(3) = ( -1.000000  0.000000  0.266222 )  


     PseudoPot. # 1 for Na read from file:
     /home/QE/espresso-5.0.2/qe-workload/workload1/workload1-upf/Na.pw91-sp-van_ak.UPF
     MD5 check sum: 3208cb13a3251b003defc34f662af023
     Pseudo is Ultrasoft, Zval =  9.0
     Generated by new atomic code, or converted to UPF format
     Using radial grid of  819 points,  6 beta functions with:
                l(1) =   0
                l(2) =   0
                l(3) =   1
                l(4) =   1
                l(5) =   2
                l(6) =   2
     Q(r) pseudized with  8 coefficients,  rinner =    0.900   0.900   0.900
                                                       0.900   0.900

     PseudoPot. # 2 for Fe read from file:
     /home/QE/espresso-5.0.2/qe-workload/workload1/workload1-upf/Fe.pw91-sp-van_ak.UPF
     MD5 check sum: f4bba93a7cc8cd1f5b3790ec7f8f1f20
     Pseudo is Ultrasoft, Zval = 16.0
     Generated by new atomic code, or converted to UPF format
     Using radial grid of  861 points,  6 beta functions with:
                l(1) =   0
                l(2) =   0
                l(3) =   1
                l(4) =   1
                l(5) =   2
                l(6) =   2
     Q(r) pseudized with  8 coefficients,  rinner =    1.500   1.500   1.500
                                                       1.500   1.500

     PseudoPot. # 3 for Fe read from file:
     /home/QE/espresso-5.0.2/qe-workload/workload1/workload1-upf/Fe.pw91-sp-van_ak.UPF
     MD5 check sum: f4bba93a7cc8cd1f5b3790ec7f8f1f20
     Pseudo is Ultrasoft, Zval = 16.0
     Generated by new atomic code, or converted to UPF format
     Using radial grid of  861 points,  6 beta functions with:
                l(1) =   0
                l(2) =   0
                l(3) =   1
                l(4) =   1
                l(5) =   2
                l(6) =   2
     Q(r) pseudized with  8 coefficients,  rinner =    1.500   1.500   1.500
                                                       1.500   1.500

     PseudoPot. # 4 for As read from file:
     /home/QE/espresso-5.0.2/qe-workload/workload1/workload1-upf/As.pw91-n-van.UPF
     MD5 check sum: e229dc2d36d87f47e336bca01d6f4d33
     Pseudo is Ultrasoft + core correction, Zval =  5.0
     Generated by new atomic code, or converted to UPF format
     Using radial grid of  875 points,  4 beta functions with:
                l(1) =   0
                l(2) =   0
                l(3) =   1
                l(4) =   1
     Q(r) pseudized with  8 coefficients,  rinner =    1.000   1.000   1.000


     PseudoPot. # 5 for O  read from file:
     /home/QE/espresso-5.0.2/qe-workload/workload1/workload1-upf/O.pw91-van_ak.UPF
     MD5 check sum: afa2cba87b59f62dd86bf02dca5c457b
     Pseudo is Ultrasoft, Zval =  6.0
     Generated by new atomic code, or converted to UPF format
     Using radial grid of  737 points,  4 beta functions with:
                l(1) =   0
                l(2) =   0
                l(3) =   1
                l(4) =   1
     Q(r) pseudized with  8 coefficients,  rinner =    0.800   0.800   0.800


     atomic species   valence    mass     pseudopotential
        Na             9.00    22.99000     Na( 1.00)
        Fe1           16.00    55.84500     Fe( 1.00)
        Fe2           16.00    55.84500     Fe( 1.00)
        As             5.00    74.92000     As( 1.00)
        O              6.00    16.00000     O ( 1.00)

     Starting magnetic structure
     atomic species   magnetization
        Na           0.000
        Fe1          0.125
        Fe2         -0.125
        As           0.000
        O            0.000

      8 Sym. Ops., with inversion, found



   Cartesian axes

     site n.     atom                  positions (alat units)
         1           Na  tau(   1) = (   0.0000000   0.0000000   1.1790912  )
         2           Na  tau(   2) = (   0.0000000   0.0000000   2.5771726  )
         3           Fe1 tau(   3) = (   0.0000000  -0.4999998   1.8781319  )
         4           Fe2 tau(   4) = (   0.4999998   0.0000000   1.8781319  )
         5           As  tau(   5) = (   0.0000000   0.0000000   0.4552592  )
         6           As  tau(   6) = (   0.0000000   0.0000000   3.3010047  )
         7           O   tau(   7) = (   0.0000000   0.0000000   1.8781319  )

     number of k points=    34  gaussian smearing, width (Ry)=  0.0020
                       cart. coord. in units 2pi/alat
        k(    1) = (   0.0000000   0.0000000   0.0665555), wk =   0.0312500
        k(    2) = (  -0.2500000   0.0000000   0.1331109), wk =   0.0625000
        k(    3) = (   0.5000000   0.0000000  -0.0665555), wk =   0.0625000
        k(    4) = (   0.2500000   0.0000000   0.0000000), wk =   0.0312500
        k(    5) = (  -0.2500000   0.2500000   0.1996664), wk =   0.1250000
        k(    6) = (   0.5000000   0.2500000   0.0000000), wk =   0.0625000
        k(    7) = (   0.2500000   0.2500000   0.0665555), wk =   0.1250000
        k(    8) = (   0.5000000  -0.5000000  -0.1996664), wk =   0.0625000
        k(    9) = (   0.2500000  -0.5000000  -0.1331109), wk =   0.0625000
        k(   10) = (   0.0000000   0.0000000   0.1996664), wk =   0.0312500
        k(   11) = (   0.7500000   0.0000000   0.0000000), wk =   0.0312500
        k(   12) = (   0.0000000  -0.2500000  -0.1331109), wk =   0.0625000
        k(   13) = (   0.0000000   0.5000000   0.0665555), wk =   0.0625000
        k(   14) = (   0.0000000   0.2500000   0.0000000), wk =   0.0312500
        k(   15) = (   0.2500000   0.5000000   0.0000000), wk =   0.0625000
        k(   16) = (  -0.5000000   0.2500000   0.1331109), wk =   0.0625000
        k(   17) = (   0.0000000   0.7500000   0.0000000), wk =   0.0312500
        k(   18) = (   0.0000000   0.0000000   0.0665555), wk =   0.0312500
        k(   19) = (  -0.2500000   0.0000000   0.1331109), wk =   0.0625000
        k(   20) = (   0.5000000   0.0000000  -0.0665555), wk =   0.0625000
        k(   21) = (   0.2500000   0.0000000   0.0000000), wk =   0.0312500
        k(   22) = (  -0.2500000   0.2500000   0.1996664), wk =   0.1250000
        k(   23) = (   0.5000000   0.2500000   0.0000000), wk =   0.0625000
        k(   24) = (   0.2500000   0.2500000   0.0665555), wk =   0.1250000
        k(   25) = (   0.5000000  -0.5000000  -0.1996664), wk =   0.0625000
        k(   26) = (   0.2500000  -0.5000000  -0.1331109), wk =   0.0625000
        k(   27) = (   0.0000000   0.0000000   0.1996664), wk =   0.0312500
        k(   28) = (   0.7500000   0.0000000   0.0000000), wk =   0.0312500
        k(   29) = (   0.0000000  -0.2500000  -0.1331109), wk =   0.0625000
        k(   30) = (   0.0000000   0.5000000   0.0665555), wk =   0.0625000
        k(   31) = (   0.0000000   0.2500000   0.0000000), wk =   0.0312500
        k(   32) = (   0.2500000   0.5000000   0.0000000), wk =   0.0625000
        k(   33) = (  -0.5000000   0.2500000   0.1331109), wk =   0.0625000
        k(   34) = (   0.0000000   0.7500000   0.0000000), wk =   0.0312500

     Dense  grid:   151529 G-vectors     FFT dimensions: ( 108, 108, 108)

     Smooth grid:    29071 G-vectors     FFT dimensions: (  64,  64,  64)

     Largest allocated arrays     est. size (Mb)     dimensions
        Kohn-Sham Wavefunctions         0.56 Mb     (    918,   40)
        NL pseudopotentials             1.34 Mb     (    918,   96)
        Each V/rho on FFT grid          9.61 Mb     ( 314928,   2)
        Each G-vector array             0.29 Mb     (  37883)
        G-vector shells                 0.29 Mb     (  37883)
     Largest temporary arrays     est. size (Mb)     dimensions
        Auxiliary wavefunctions         2.24 Mb     (    918,  160)
        Each subspace H/S matrix        0.39 Mb     ( 160, 160)
        Each <psi_i|beta_j> matrix      0.06 Mb     (     96,   40)
        Arrays for rho mixing          38.44 Mb     ( 314928,   8)

     Initial potential from superposition of free atoms

     starting charge   63.99761, renormalised to   66.00000
     Starting wfc are   48 randomized atomic wfcs

     total cpu time spent up to now is     1431.8 secs

     per-process dynamical memory:   157.9 Mb

     Self-consistent Calculation

     iteration #  1     ecut=    40.00 Ry     beta=0.30
     Davidson diagonalization with overlap
     ethr =  1.00E-02,  avg # of iterations =  4.8

     total cpu time spent up to now is     5730.2 secs

     WARNING: integrated charge=    65.64162347, expected=    66.00000000

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
     Error in routine electrons (1):
     charge is wrong
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

     stopping ...
APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Hangup (signal 1)
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xueshichuan 的主题更新
信息提示
请填处理意见