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fxlei

铜虫 (初入文坛)

[交流] [求助]AutoDock4如何把结果生成PDB文件

现在算出了dlg,但不知怎样把结果输出为PDB。

拜读了wjmed大人的文章(http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=644156

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提取结果:
  $get-docked lig.macro.dlg
---------------------------------------------

但我找不到get-docked这个文件,命令行输入get-docked,提示“command not found”

新虫+菜鸟,希望各位大侠赐教一下。感激。
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luai071

木虫 (著名写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):要是再能详细介绍一下就更好了
据我所知应该是用“get-dockings”吧
2楼2008-02-27 10:04:47
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weishenme

金虫 (小有名气)


zzgyb(金币+1,VIP+0):要是再能详细介绍一下就更好了
直接用ADT吧。
3楼2008-03-11 10:19:28
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weishenme

金虫 (小有名气)

Analyze-Docking-Open
Analyze-Conformations-Load
选择你需要的构象,双击
Files-writepdb
这样对接好的受体就保存下来了。
4楼2008-03-15 10:16:25
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