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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求指导为什么我算的纳米球的势能居然随着温度的升高而变小？
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skywyy2011

新虫 (正式写手)

[求助] 求指导为什么我算的纳米球的势能居然随着温度的升高而变小？ 已有1人参与

我使用forcite软件，在compass力场下计算壳层结构氧化层包覆着的金属纳米球的熔点随温度升高的变化规律，具体过程如下：先建立一个边长为4nm的立方盒子，然后建立一个直径4nm的纳米球，把纳米球放入盒子中，进行优化（geometric optimization）（包含cell optimzation），得到稳定构型。然后在此稳定构型之上在不同温度下（300k 到1000k）进行分子动力学（dynamic）模拟，此处我分别试了NVT系综和NPT系综，Time step设为0.7fs,numbers  of steps 为10000，整个simulation time 为7ps， Thermostat为Nose，但是计算结果居然显示随着温度升高体系的平均势能(average potential energy)居然在下降（两个系综下都是这样的），这明显是错误的，求各位虫友帮我看看我哪里出了错误，刚开始接触分子动力学，很多地方都不太懂，又没人教，只能自己摸索，谢谢各位了！
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天道酬勤
1楼 2014-03-17 12:15:52
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
skywyy2011: 金币+5, ★有帮助 2014-03-18 12:21:06
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2014-03-18 17:02:24
4纳米的盒子 4纳米的球
那你模拟的是个由4纳米小球组成的多孔材料。。
温度升高发生原子扩散，球形变成多面体 表面能减小 当然势能会下降
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2楼2014-03-18 10:31:40
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skywyy2011

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lei0736 at 2014-03-18 10:31:40
4纳米的盒子 4纳米的球
那你模拟的是个由4纳米小球组成的多孔材料。。
温度升高发生原子扩散，球形变成多面体 表面能减小 当然势能会下降

谢谢您的回复，但是我之前用同样的方法算纯金属颗粒时，势能是随着温度的升高而增大的，为什么现在换成氧化层包覆着纯金属的纳米球结构势能就随着温度的升高而降低呢？那按您这么说采用非周期性结构就可以解决这个问题了么？
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天道酬勤
3楼2014-03-18 12:20:59
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sciencejoy

新虫 (著名写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-18 17:02:45
难道不应该下降吗？
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4楼2014-03-18 13:11:51
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skywyy2011

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sciencejoy at 2014-03-18 13:11:51
难道不应该下降吗？

文献中都是说随着温度的升高而升高的

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天道酬勤
5楼2014-03-18 13:39:01
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 应助指数+1, 鼓励交流！ 2014-03-18 17:02:54
建议进行结构分析
应该是发生了原子的扩散 如金属原子进入氧化物层或反之 形成更稳定的氧化物
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6楼2014-03-18 16:09:19
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skywyy2011

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lei0736 at 2014-03-18 16:09:19
建议进行结构分析
应该是发生了原子的扩散 如金属原子进入氧化物层或反之 形成更稳定的氧化物

可是我在单独计算纯氧化铝纳米球时，发现它的势能也是随着温度的升高而降低的，还有我发现在弛豫的过程中，输出文件提示我“the simulation box is not neutral”,这个对我的体系有影响么？还有输出文件中有三个势能，分别是initial，final以及average，我该用哪个呢？average么？
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天道酬勤
7楼2014-03-18 18:41:48
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sciencejoy

新虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by skywyy2011 at 2014-03-18 13:39:01
文献中都是说随着温度的升高而升高的
...

熔化，固体变成液体，明显液体的势能比固体的势能低啊，要不然怎么会熔化？
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8楼2014-03-19 09:07:50
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skywyy2011

新虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by sciencejoy at 2014-03-19 09:07:50
熔化，固体变成液体，明显液体的势能比固体的势能低啊，要不然怎么会熔化？...

如果还没达到熔点呢？

[ 发自小木虫客户端 ]
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天道酬勤
9楼2014-03-19 11:47:24
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sciencejoy

新虫 (著名写手)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-19 20:43:54
引用回帖:
9楼: Originally posted by skywyy2011 at 2014-03-19 11:47:24
如果还没达到熔点呢？
...

温度越高，表示动能越大，就越要摆脱势能束缚，势能降低
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10楼2014-03-19 17:31:00
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