24СʱÈÈÃŰæ¿éÅÅÐаñ    

²é¿´: 1663  |  »Ø¸´: 3

wdaobin

¾èÖú¹ó±ö (ÕýʽдÊÖ)

[ÇóÖú] OpenmxÖÐGrapheneµÄÓÅ»¯ÎÊÌ⣡ ÒÑÓÐ2È˲ÎÓë

СϺ×î½üÔÚѧϰOpenmx£¬ÏëÓÃËüÀ´ÓÅ»¯Graphene£¬Ôª°ûÖÐʹÓÃÁËÁ½¸öCÔ­×Ó£¬µ«ÊÇÒ»Ö±µÃ²»µ½ÊÕÁ²µÄ½á¹û£¬³ÌÐòÒ»Ö±ÔËÐе½×î´óÑ­»·ÊýÈ»ºó±»Ç¿ÖÆÖÕÖ¹£¬Çë´óÏÀ°ïæ¿´¿´ÎÊÌâ³öÔÚÄÄÁË£¿Ð»Ð»£¡ÏÂÃæÊÇÎÒµÄÊäÈëÎļþ£º
# Graphene written by XXX
System.CurrrentDirectory /home/wangdb/Workspaces/Openmx/work-wdb/ # default=./
System.Name graphene
DATA.PATH /home/wangdb/Workspaces/Openmx/DFT_DATA06 # default=../DFT_DATA11
level.of.stdout 1 # default=1 (1-3)
level.of.fileout 1 # default=1 (1-3)


# Definition of Atomic Species
Species.Number 1
<Definition.of.Atomic.Species
C C6.0-s2p2d1 C_PBE
Definition.of.Atomic.Species>


# Atoms
Atoms.Number 2
Atoms.SpeciesAndCoordinates.Unit FRAC # Ang|AU
<Atoms.SpeciesAndCoordinates # Unit=Ang.
1 C 0.000000000000 0.000000000000 0.000000000000 2.0 2.0
2 C 0.333333333333 -0.333333333333 0.000000000000 2.0 2.0
Atoms.SpeciesAndCoordinates>
Atoms.UnitVectors.Unit AU # Ang|AU
<Atoms.UnitVectors # unit=Ang.
2.3045392835 3.99157912706038 0.000000000000
2.3045392835 -3.99157912706038 0.000000000000
0.000000000000 0.000000000000 20.9080342511016
Atoms.UnitVectors>


# SCF or Electronic System
scf.XcType LDA # LDA|LSDA-CA|LSDA-PW
scf.SpinPolarization off # On|Off
scf.ElectronicTemperature 300.0 # default=300 (K)
scf.energycutoff 700.0 # default=150 (Ry)
scf.maxIter 100 # default=40
scf.EigenvalueSolver band # Recursion|Cluster|Band
scf.lapack.dste dstevx # dstegr|dstedc|dstevx, default=dstegr
scf.Kgrid 24 24 1 # means 4x4x4
scf.Mixing.Type rmm-diisk # Simple|Rmm-Diis|Gr-Pulay
scf.Init.Mixing.Weight 0.010 # default=0.30
scf.Min.Mixing.Weight 0.001 # default=0.001
scf.Max.Mixing.Weight 0.200 # default=0.40
scf.Mixing.History 15 # default=5
scf.Mixing.StartPulay 5 # default=6
scf.criterion 1.0e-6 # default=1.0e-6 (Hartree)


# 1D FFT
1DFFT.NumGridK 900 # default=900
1DFFT.NumGridR 900 # default=900
1DFFT.EnergyCutoff 3600.0 # default=3600 (Ry)


# SCF Order-N
orderN.HoppingRanges 8.389 # default=5.0 (Ang)
orderN.NumHoppings 2 # default=2
orderN.KrylovH.order 800 # default=400


# MD or Geometry Optimization
MD.Type opt # Nomd|Opt|DIIS|NVE|NVT_VS|NVT_NH
MD.Opt.DIIS.History 7 # default=7
MD.Opt.StartDIIS 5 # default=5
MD.maxIter 100 # default=1
MD.TimeStep 1.0 # default=0.5 (fs)
MD.Opt.criterion 1.0e-7 # default=1.0e-4 (Hartree/bohr)
»Ø¸´´ËÂ¥
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

jpchou

ר¼Ò¹ËÎÊ (ÖøÃûдÊÖ)

¡¾´ð°¸¡¿Ó¦Öú»ØÌû

¡ï ¡ï
¸Ðл²ÎÓ룬ӦÖúÖ¸Êý +1
fzx2008: ½ð±Ò+2, ллָµ¼ 2014-03-17 10:32:06
ÎÒÓXµÃÄãÖ±½ÓÈ¥ OPENMX ¹Ù·½°l†–•þ±ÈÝ^¿ì
http://www.openmx-square.org/forum/patio.cgi
СľÏxÉÏËÆºõºÜºÜºÜÉÙÈËÓà OPENMX
OPENMX.... ²»ºÃÉÏÊÖ
2Â¥2014-03-17 03:54:12
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

y1ding

Ìú¸Ëľ³æ (ÖøÃûдÊÖ)

¡¾´ð°¸¡¿Ó¦Öú»ØÌû

¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï ¡ï
¸Ðл²ÎÓ룬ӦÖúÖ¸Êý +1
wdaobin: ½ð±Ò+10, ¡ï¡ï¡ïºÜÓаïÖú, лл£¡ 2014-03-19 21:06:53
scf.energycutoff 200.0 # default=150 (Ry)

<Definition.of.Atomic.Species
C C6.0-s2p2d1 C_CA13
Definition.of.Atomic.Species>

¸Ä¶¯2´¦£¬¿ÉÒÔÊÕÁ²

*******************************************************
                Total Energy (Hartree) at MD = 4        
*******************************************************

  Uele  =      -3.916208267222

  Ukin  =       8.305197749056
  UH0   =    -115.945584489942
  UH1   =       0.030973892655
  Una   =      -5.898807821628
  Unl   =      -1.050688172920
  Uxc0  =      -1.927500964985
  Uxc1  =      -1.927500964985
  Ucore =     106.751941650432
  Uhub  =       0.000000000000
  Ucs   =       0.000000000000
  Uzs   =       0.000000000000
  Uzo   =       0.000000000000
  Uef   =       0.000000000000
  UvdW  =       0.000000000000
  Utot  =     -11.661969122317

  Note:

  Utot = Ukin+UH0+UH1+Una+Unl+Uxc0+Uxc1+Ucore+Uhub+Ucs+Uzs+Uzo+Uef+UvdW

  Uele:   band energy
  Ukin:   kinetic energy
  UH0:    electric part of screened Coulomb energy
  UH1:    difference electron-electron Coulomb energy
  Una:    neutral atom potential energy
  Unl:    non-local potential energy
  Uxc0:   exchange-correlation energy for alpha spin
  Uxc1:   exchange-correlation energy for beta spin
  Ucore:  core-core Coulomb energy
  Uhub:   LDA+U energy
  Ucs:    constraint energy for spin orientation
  Uzs:    Zeeman term for spin magnetic moment
  Uzo:    Zeeman term for orbital magnetic moment
  Uef:    electric energy by electric field
  UvdW:   semi-empirical vdW energy

  (see also PRB 72, 045121(2005) for the energy contributions)


*******************************************************
           Computational times (s) at MD = 4            
*******************************************************

  DFT in total      =   12.12758

  Set_OLP_Kin       =    1.44986
  Set_Nonlocal      =    2.16248
  Set_ProExpn_VNA   =    2.26113
  Set_Hamiltonian   =    1.70408
  Poisson           =    0.00246
  diagonalization   =    0.50167
  Mixing_DM         =    0.01076
  Force             =    1.85790
  Total_Energy      =    0.92433
  Set_Aden_Grid     =    0.02858
  Set_Orbitals_Grid =    0.27365
  Set_Density_Grid  =    0.89989
  RestartFileDFT    =    0.02197
  Mulliken_Charge   =    0.00213
  FFT(2D)_Density   =    0.00316

*******************************************************
             MD or geometry opt. at MD = 4              
*******************************************************

<Steepest_Descent>  SD_scaling= 0.944854433488
<Steepest_Descent>  |Maximum force| (Hartree/Bohr) = 0.000000022448
<Steepest_Descent>  Criterion       (Hartree/Bohr) = 0.000000100000

  atom=  1, XYZ(ang) Fxyz(a.u.)=  -0.0000   -0.0000    0.0000    -0.0000    0.0000    0.0000
  atom=  2, XYZ(ang) Fxyz(a.u.)=   1.2195   -0.7041   -0.0000     0.0000   -0.0000   -0.0000

outputting data on grids to files...


***********************************************************
***********************************************************
               Computational Time (second)                 
***********************************************************
***********************************************************

                               Min_ID   Min_Time       Max_ID   Max_Time
   Total Computational Time =     4       67.461          0       68.100
   readfile                 =     7        6.883          0        6.886
   truncation               =     5        1.936          1        2.428
   MD_pac                   =     0        0.028          5        0.036
   OutData                  =     1        1.956          0        2.593
   DFT                      =     1       56.048          5       56.540

*** In DFT ***

   Set_OLP_Kin              =     5        1.045          0        5.790
   Set_Nonlocal             =     0        8.654          5       13.400
   Set_ProExpn_VNA          =     5        6.023          0        8.983
   Set_Hamiltonian          =     1       11.370          6       11.370
   Poisson                  =     7        0.014          1        0.015
   Diagonalization          =     0        3.395          1        3.395
   Mixing_DM                =     7        0.070          0        0.070
   Force                    =     1        7.363          6        7.363
   Total_Energy             =     6        3.596          0        3.693
   Set_Aden_Grid            =     0        0.116          5        3.067
   Set_Orbitals_Grid        =     3        0.000          0        1.102
   Set_Density_Grid         =     4        5.358          0        5.364
   RestartFileDFT           =     5        0.066          7        0.895
   Mulliken_Charge          =     1        0.009          7        0.010
   FFT(2D)_Density          =     7        0.068          3        0.068
   Others                   =     1        0.091          5        1.694

The calculation was normally finished.
3Â¥2014-03-17 16:20:25
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû

wdaobin

¾èÖú¹ó±ö (ÕýʽдÊÖ)

ллy1ding£¬ÎÊÌâÒѽâ¾ö£¬²»¹ýÎÒ·¢ÏÖÔÚ3.5ÉÏÈÔÈ»²»ÊÕÁ²£¬ÔÚ3.7ÉÏÔËÐе½MD=13ʱ¼ÆËãÕý³£½áÊøÁË¡£ÒÔºó»¹Çë¶à¶àÖ¸½Ì£¡
4Â¥2014-03-19 21:12:31
ÒÑÔÄ   »Ø¸´´ËÂ¥   ¹Ø×¢TA ¸øTA·¢ÏûÏ¢ ËÍTAºì»¨ TAµÄ»ØÌû
Ïà¹Ø°æ¿éÌø×ª ÎÒÒª¶©ÔÄÂ¥Ö÷ wdaobin µÄÖ÷Ìâ¸üÐÂ
×î¾ßÈËÆøÈÈÌûÍÆ¼ö [²é¿´È«²¿] ×÷Õß »Ø/¿´ ×îºó·¢±í
[¿¼ÑÐ] ÊÛSCIÒ»ÇøT0PÎÄÕ£¬ÎÒ:8.O.55.1.O.5.4,¿ÆÄ¿È«,¿É+¼± +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 4/200 2026-08-26 02:04 by cNXvBfCpiZOM
[»ù½ðÉêÇë] ÔÚ¼á±ù»¹¸Ç×ű±º£µÄʱºò£¬ÎÒ¿´µ½ÁËÅ­·ÅµÄ÷»¨¡£ (½ð±Ò+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[»ù½ðÉêÇë] ÓÐûÓдóÉñ°ïÎÒ¿´¿´»ù½ð´úÂë 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[»ù½ðÉêÇë] ijЩ»ú¹¹£¬ÒÔЧÂʵÍΪÈÙ£¬ÒÔЧÂʵÍ×÷Ϊ´æÔڸР+9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[»ù½ðÉêÇë] ½ñÈÕ²»·Å°ñ£¿Íø´«¹ú×ÔȻԤ¼Æ 8 Ô 27 Èտɲé½á¹û +17 ҽѧÀÏÄк¢ 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by ҽѧÀÏÄк¢
[»ù½ðÉêÇë] Èç¹û´Ë¿ÌÄãÕýÔÚΪ¹ú»ù¸Ðµ½½¹ÂÇ£¬²»·ÁÀ´ÌýÌýÕâÊס¶»ù½ðÖ®Íâ¡· +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[»ù½ðÉêÇë] ûÓÐÈκÎÏûÏ¢-ÊDz»ÊǾÍÁ¹ÁË +9 ͼÀ²Í¼À² 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by ÄϺ£Ð¡¸ç
[»ù½ðÉêÇë] ÈËÆø²»ÐÐÁË +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by ¹Â¶ÀµÄÓ¢ÐÛ6
[½Ìʦ֮¼Ò] µ¼Ê¦Í²ۣºÎÒÔõô̯ÉÏÁËÕâô¸ö¼«Æ·Ñо¿Éú£¡ +3 ËÕ¶«ÆÂ¶þÊÀ 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[»ù½ðÉêÇë] ½ñÌì»ù½ð»á³ö½á¹ûÂð£¿20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[»ù½ðÉêÇë] ÎÒÃæÉÏÍêµ°ÁË +13 ÇÒÌý»¢Ð¥ 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[»ù½ðÉêÇë] ·¶½øÖоÙÒ»ÎĵÄÖÐÐÄ˼Ïë +7 Ñ׻ƹóëÐ 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[»ù½ðÉêÇë] ÄÜ·ñÍ˳ö²ÎÓëµÄÃæÉÏÏîÄ¿½â³ýÏÞÏî +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by ¼ÒÓëÔ¶·½
[»ù½ðÉêÇë] ÈÃÎÒÖÐÒ»¸öÃæÉϰɣ¡ +13 ´óƼ1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by ̫ɵÁË
[»ù½ðÉêÇë] ¿ÆÑй¶ùÌ«ÄÑÁË +18 ÎÒ4´ó°×²Ë 2026-08-20 19/950 2026-08-24 09:47 by ¿­¶÷¹ãÊ¢´ß»¯·ÖÎ
[»ù½ðÉêÇë] ʱ¼ä´Á½ñÌ죬20ºÅ±äÁË +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[»ù½ðÉêÇë] ¿´À´½ñÌì²»»á·Å°ñÁË£¿ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[»ù½ðÉêÇë] ʱ¼ä´ÁÓÖ±äÁË +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by ×Ïɼ´¼
[»ù½ðÉêÇë] Ó¦¸ÃÊÇÏÂÖÜÈý26ÈÕ¹«²¼Á˰ɣ¿ +4 ¹þ¹þ¸ò£¿ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[»ù½ðÉêÇë] ½ñÌì·Å°ñûϷÁ衃 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
ÐÅÏ¢Ìáʾ
ÇëÌî´¦ÀíÒâ¼û