| 查看: 1158 | 回复: 0 | ||
a94259425木虫 (小有名气)
|
[求助]
MS计算HessianAtoms的partial Hessian出现的虚频个数及消除问题
|
|
由于没有老师带计算 问的问题可能小白 见谅 我在搜索H迁的的过渡态后计算频率，选取了七个原子作为HessianAtoms计算partial Hessian，可是得到的频率结果中是-1000多为首的，其余从-300到0总共21个虚频，后来换了一个模型，还是得到HessianAtoms的原子个数*3个虚频。1.论坛里“根据虚频对应的振动位移，把这些位移，乘以一个适当大小的因子，直接和原来平衡构型相加，就得到新的构型了”这个方法在所有频率和单个频率时试了多次，虚频个数还是21个。2.将计算partial Hessian后的模型直接进行TS OPT后-1000多的虚频没了，还是从-300开始的21个虚频。 想问一下这21个虚频为什么怎么也消不掉？是不是我计算的过程遗漏了一些东西？再请教MS DMOL3计算过渡态并进行确认的步骤。 卡这好长时间了 求大虾 顺便补充一下模型：cluster模型，部分fix其余部分relax，选为HessianAtoms的原子全部为relax。 |
回复此楼» 猜你喜欢
博士去二本高校当辅导员，如何调整心态？
已经有10人回复
-
面上有专家说实验设备不是我们单位的
已经有6人回复
-
27细胞生物学申博
已经有5人回复
-
江苏省自然基金 什么时候出结果
已经有6人回复
-
广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才！！！
已经有11人回复
-
闲聊
已经有3人回复
-
如何查询2026年获批项目名称？
已经有3人回复
-
两块石头
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有15人回复
-
面上没中，邀请各位路过的虫友分析一下分数
已经有13人回复