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moye1991

新虫 (初入文坛)

[求助] 求读取PDB文件的C语言程序 已有3人参与

求!!!一个能读取pdb文件原子坐标的C语言程序,感激不尽!!!
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姜志文

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-14 08:22:17
额……我觉得直接中word强制打开也能看到坐标吧,打开后每个原子后面都有三列,应该是坐标值
求读取PDB文件的C语言程序
1.png

2楼2014-03-13 14:48:49
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-14 08:22:30
直接转成gro,打开复制粘贴出来不行么?
gromacs
3楼2014-03-13 15:09:27
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-15 16:03:15
蛋白结构的pdb文件吗?
很多软件可以吖,pymol,VMD,ADT等等软件都可以打开吖
4楼2014-03-15 15:23:18
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moye1991

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 姜志文 at 2014-03-13 14:48:49
额……我觉得直接中word强制打开也能看到坐标吧,打开后每个原子后面都有三列,应该是坐标值

1.png

唉。其实我是需要分析数据的,读出坐标,算出两个蛋白质的最近原子间的距离
5楼2014-03-17 09:52:09
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moye1991

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by fangsteel at 2014-03-13 15:09:27
直接转成gro,打开复制粘贴出来不行么?

是需要用坐标算一些数据的,所以要自己写程序读出来
6楼2014-03-17 09:52:47
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-17 18:53:48
引用回帖:
6楼: Originally posted by moye1991 at 2014-03-17 09:52:47
是需要用坐标算一些数据的,所以要自己写程序读出来...

直接把坐标复制到一个文件里,用fscanf读到一个数组里a【N】[3]不就能用了
gromacs
7楼2014-03-17 12:01:38
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