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lq102021

金虫 (小有名气)

[求助] 关于章张等的ParaAT工具的使用

有谁用过章张等的ParaAT工具,在windows下面如何使用,1. Before running
Please make sure the following programs are put into the global directory and can be accessible from any working directory.
        (1). ParaAT.pl;
        (2). Epal2nal.pl;
        (3). Multiple sequence aligner (clustalw2 | t_coffee | mafft | muscle).
这些该如何操作,我是现在win8的环境变量PATH中添加了ParaAT(里面存放有 ParaAT.pl和Epal2nal.pl以及测试文件)的路径如D:\ParaAT\;然后在把Epal2nal.pl的属性改为可执行,然后用cmd的窗口输入D:\ParaAT\ParaAT.pl -h test.homologs -n test.cds -a test.pep -p proc -o out.axt  但是运行结果是
Checking input parameters: [OK]
Use of uninitialized value $PATH[19] in concatenation (.) or string at D:\Instal
l\ParaAT\ParaAT.pl line 470.
Checking Epal2nal.pl: [NA]
Please make sure Epal2nal.pl is executable (+X) and put into the global director
yy.
这是为什么?求帮忙!谢谢!
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woody196

木虫 (著名写手)

楼主可否讲这个软件共享一下呀,我下载不到,谢谢了,邮箱woody196@126.com
2楼2015-05-25 21:49:16
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vilenk

木虫 (著名写手)

请问楼主这个问题解决了吗?
3楼2019-04-29 17:59:57
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