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铜虫 (小有名气)

[求助] DNase-seq技术咨询已有1人参与

DNase-seq获得开放染色质的区域，有点不明白的是DNA核酸酶超敏感位点不是被DNaseⅠ消化么？DNaseⅠ消化仅仅是把DNA链切断，不消化中间开放的区域吧？要不然怎么获得开放区的序列？DNA核酸酶超敏感位点位点是不是仅仅指核小体的边缘的DNA序列？有专门的定义吗？

1楼 2014-03-09 11:17:04

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木虫 (小有名气)

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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-12 10:18:54

用DNase 把没有核小体缠绕的DNA片断切出，并测序。需要titrate amount of DNase,来防止完全消化中间开放的区域.DNA核酸酶超敏感位点位点是指缺少核小体，甲基化程度低，的开放染色质区域，将会被DNase首先切割的位点。

3楼2014-03-11 19:47:52

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